据不完全统计，PubMed已发表的database已经超过50万个，已发表的工具同样超过50万个（这还是没有把各种各样的算法统计进来的结果）。不管是数据库还是工具，其目的应该都是为了方便科研人员使用的（那些UI或者使用体验极差的这里先按下不表！）。此外，对于很多数据库和工具，网上都有许多教程或者课程。不管花钱也好，免费的也好，如果只是跟着课程走一遍，最后的结果很有可能就是学废了，但是还是发不了文章。今天小编以一篇4分的文章为例，跟大家分享一下，公共数据库和在线分析工具，到底应该怎么用。
文章三月份发表在Journal of Translational Medicine（IF: 4.124）。
Expression and prognostic roles of PRDXs gene family in hepatocellular carcinoma
PRDXs基因家族在肝细胞肝癌中的表达和预后作用
一、摘要：
作为世界第四大癌症相关死亡原因，肝细胞肝癌的治疗效果和5年生存并不乐观。先前的研究表明，PRDXs与癌症的发生发展密切相关。
二、材料方法：
CCLE，UALCAN，HCCDB，Human Protein Atlas，K-M，cBioportal，LinkedOmics
三、结果：
1.不同数据库中PRDXs在HCC的表达情况。具体来说，在CCLE（图1），UALCAN（图2.a-b），HCCDB（图2.c-d）在线分析了表达水平。
2.PRDXs基因家族蛋白水平以及与临床特征的相关性。使用HPA数据库，在线分析PRDXs蛋白表达水平（图3.a-b），UALCAN数据库在线分析了PRDXs与临床特征关系（表1）。
3.PRDXs水平与OS的关系。使用Kaplan–Meier plotter（图3.c-d）在线制作KM曲线。
4.HCC中PRDXs遗传改变。使用cBioportal（图4，表2）在线分析PRDXs的遗传改变与neighborhood基因网络。
5.HCC中PRDXs相关差异表达基因KEGG通路分析。使用LinkedOmics（图5）在线分析和作图。
总结：
PRDXs家族基因与HCC患者预后相关，提示这些基因可能成为HCC新的治疗和预后分子靶点。
文章到此也就结束了。如果从整体上来看，会觉得很简单，用的工具都是在线的工具，分析和作图都是在线完成。想想那些为了三分文章辗转反侧的夜晚，这种方式也太轻松了。所以，从在线工具到真正的4分的文章的距离，就是你和idea的距离。真希望有大佬可以做一个idea的数据库。
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