主人公威尔是一家研究院的职员，从事研究一种治疗老年痴呆的药物ALZ—112，这种药物他研究了五年，终于在一只大猩猩身上看到了药物的成功。他决定向上级请示在人身上做实验。
当他在给投资商讲解他的研究的时候，被用来做实验的大猩猩突然抓狂了，逃了出去然后被枪杀。投资商没有给威尔投资，甚至停止了威尔的研究项目。在清理死去大猩猩住的屋子的时候，意外的发现一只小猩猩，原来大猩猩抓狂不是侵略性的，而是她生下了一只小猩猩，她的行为只是一种保护欲而已。
小猩猩被威尔偷偷带回了家。威尔的父亲是一位老年痴呆患者，曾经他是一位最受欢迎的钢琴家，但是现在的他已经不会弹钢琴了。威尔把小猩猩给他的父亲带，却突然发现小猩猩的智商相当惊人，然后他们给他取了一个名字，凯撒。
凯撒一天天长大，阁楼上的那个铜钱形状的小窗就是他了解外面世界的渠道，他看见邻居家的小孩在马路上骑自行车，他就偷偷的一个人出去了，他也想骑一下这个好玩的东西，他甚至想跟他们一起玩，但是孩子们吓坏了，邻居家的大人拿棒球棒打他，甚至弄伤了他的腿。
给他医治的医生建议威尔带他出去放放风，于是他们一起去了红树林，年复一年，红树林陪伴着凯撒一点点长大。
凯撒的智商越来越高，他开始对自己的来历和生活产生了怀疑，威尔只好带他去他的研究院把他的母亲是怎样的一个实验品，然后怎样被枪杀的事情告诉了他。
威尔的父亲的机能对112号药物产生了抗体，老年痴呆病情更加严重了，他弄坏了邻居的车，跟邻居起争执的时候被凯撒看到了，凯撒因为自己身世的事情心情并不美好，以至于所有的情绪全部发泄在了邻居身上，并咬伤了邻居。
凯撒被送到了猩猩收容所，在收容所里遭到同类的排挤，和管理员的欺辱。他悲伤又绝望，捡起一块石头在墙上画了一个铜钱的形状，那是他曾经住的阁楼上的那扇窗，他曾经就是那样趴在那扇窗上看隔壁小孩玩耍，闭上眼睛他甚至听到了小孩子的嬉笑声。
再后来的主人探视下，凯撒强烈要求主人带他走，但是威尔没有权利带走他，他一气之下擦掉了那个他画的窗，他的梦寐以求的理想寄托。然后他做了一个决定，他决定逃走。而且要带领所有的猩猩逃走。
红毛智者告诉凯撒说猿都蠢，没法领导他们。凯撒想起了威尔给他父亲治病的药就放在冰箱里，然后他逃了出来，偷偷跑回家从冰箱里偷了113号气体药物，在关押猩猩的笼子里释放了那种药物，然后所有的猩猩都变聪明了，也明白了凯撒的计划。
可是他们又能逃到哪儿去呢？凯撒想起了红树林，那个陪伴他长大的地方。然后凯撒带领他们逃走了，之后上演了一部人猿大战。（附:人猿大战应该算是最精彩的一部分。）他甚至来到了威尔的研究所，救走了研究所里用来做实验的猩猩们，以及动物园里的猩猩们。后来他们终于到了红树林，威尔闻声赶来，他对凯撒的行为充满了内疚，并跟凯撒道歉，他请求凯撒跟他回家，凯撒趴在他的耳旁说，凯撒已经回家了。
威尔终于明白，凯撒已经找到自己的家了，找到了那个真正属于他的家。
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