简单总结:
增删改操作多用InnoDB
需要使用事务用InnoDB
如果系统崩溃后需要自我修复使用InnoDB
读操作多用MyISAM
需要偏重性能使用MyISAM
需要全文检索使用MyISAM(mysql5.7的innodb已支持全文索引)
InnoDB支持事务,回滚和崩溃修复能力,行锁,外键而MyISAM不支持
MySQL5.5版本开始Innodb已经成为Mysql的默认引擎(之前是MyISAM)，说明其优势是有目共睹的，如果你不知道用什么，那就用InnoDB，至少不会差。
1. InnoDB支持事务，MyISAM不支持
对于InnoDB每一条SQL语言都默认封装成事务，自动提交，这样会影响速度，所以最好把多条SQL语言放在begin和commit之间，组成一个事务；
2. InnoDB支持外键，而MyISAM不支持。
对一个包含外键的InnoDB表转为MYISAM会失败；
3. InnoDB是聚集索引
数据文件是和索引绑在一起的,必须要有主键，通过主键索引效率很高。但是辅助索引需要两次查询，先查询到主键，然后再通过主键查询到数据。因此，主键不应该过大，因为主键太大，其他索引也都会很大。而MyISAM是非聚集索引，数据文件是分离的，索引保存的是数据文件的指针。主键索引和辅助索引是独立的。
4. InnoDB不保存表的具体行数
执行select count(*) from table时需要全表扫描。而MyISAM用一个变量保存了整个表的行数，执行上述语句时只需要读出该变量即可，速度很快；
5. InnoDB不支持全文索引(mysql5.7的innodb已支持全文索引)
而MyISAM支持全文索引，查询效率上MyISAM要高；
6. InnoDB提供行锁
InnoDB行锁是通过给索引上的索引项加锁来实现的，这一点MySQL与Oracle不同，后者是通过在数据块中对相应数据行加锁来实现的。InnoDB这种行锁实现特点意味着：只有通过索引条件检索数据，InnoDB才使用行级锁，否则，InnoDB将使用表锁！
InnoDB表的行锁也不是绝对的，如果在执行一个SQL语句时MySQL不能确定要扫描的范围，InnoDB表同样会锁全表，例如update table set num=1 where name like “%aaa%”
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