2019年9月week1 病毒整合在隐匿性HBV感染期间驱动多灶

Chen XP, Long X, Jia WL, et al. Viral integration drivesmultifocal HCC during the occult HBV infection. Journal of experimental & clinical cancer research
CR. 2019;38(1):261

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背景
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标本类型及来源
本研究中OBI患者的肝脏具有血管转移性侵袭和多个肿瘤的表征。

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10个手术标本：
（1）6个肿瘤：从最大的肿瘤部位获得的T1，在右肝叶中发现的3个较小的肝肿瘤（T2-T4），以及栓塞HCC在肝静脉和门静脉中的转移沉积（HVTT和PVTT）。
（2）4个对照：来自相邻非肿瘤肝组织（N1-N4）

生信部分
通过病毒体捕获测序（VCS）鉴定具有整合的HBV-B2 DNA的所有样品。
寻找HBV整合和病毒重排。
单细胞VCS数据识别肿瘤内的异质性。
通过全基因组测序（WGS）揭示肿瘤内HBV整合位点的常见“局部单倍型”。
常见全基因组体细胞改变揭示了多灶性HCC的单克隆起源。

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验证部分

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