Benchmarking algorithms for pathway activity transformation of single-cell RNA-seq data
Benchmarking algorithms for pathway activity transformati...
前言 基于单细胞数据进行通路活性的评分软件已经有很多款了,Immugent在之前的一篇推文:一文带你了解单细胞数据...
前言 在SCPA系列的第一篇推文:SCPA:系统性评估单细胞亚群通路活性[https://mp.weixin.qq...
单细胞的通路分析 在做单细胞的通路分析的时候,第一就想做GO,KEGG,当然这是对于差异基因,但是单细胞的差异基因...
异常细胞信号会引起癌症等其他疾病,并且是常见的治疗的靶点。常可以通过基因的表达来推断某个信号通路的活性。然而,只考...
目前已有的单细胞数据库中,SCDevDB专注的是人不同发育通路的单细胞基因表达谱,JingleBells提供有关免...
使用AUCell识别单细胞rna数据中具有活性“基因集”(i.e. gene signatures)的细胞。AUC...
AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集(如gene signature,gene module)的细胞...
单细胞转录组细胞比例: 关于单细胞比例的计算和作图我们之前出过3期,单细胞比例的展示是很多单细胞文章必不可少的内容...
前言 不知道大家在分析单细胞数据时有没有想过一步将所有功能通路全部筛选一遍,从而筛选出有差异的一些通路进行更深入的...
本文标题:单细胞通路活性计算
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/iaefnktx.html
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