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varianceStabilizingTransformatio

varianceStabilizingTransformatio

作者: 装在瓶子里的阳光_2a70 | 来源:发表于2019-06-12 15:55 被阅读0次

    dds <- DESeqDataSetFromMatrix(countData = exprSet,colData = colData, design = ~ group_list)
    dds_2 <- DESeq(dds)

    vsd <- assay(varianceStabilizingTransformation(dds))
    vsd_2 <- assay(varianceStabilizingTransformation(dds_2))

    对于这个函数,一直在纠结varianceStabilizingTransformation() 括号里面是加dds还是dds_2。运行上述代码发现vsd与vsd_2数据是完全一致的,所以不用过多纠结。。。。

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