美文网首页
复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellc

复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellc

作者: KS科研分享与服务 | 来源:发表于2023-06-17 20:49 被阅读0次

之前微信群发布了一个图希望我们复现,是一篇science子刊的文章。展示的是细胞通讯的受配体对的表达情况。特点是受配体配对连线并展示了表达量。

image.png

(Singlecell RNA sequencing highlights intratumor heterogeneity and intercellular network featured in adamantinomatous craniopharyngioma)

原文的方法部分描述如下,可以看出,作者展示的是cellchat结果的受配体对。但是我想cellphonedb的结果也是可以这样展示的。

image.png

复现这个还是花费了一番功夫,复现结果如下,结果最后需要用AI稍微排版一下,效果就更完美了。


image.png

学习这一节的内容,其实不仅仅是这个图的复现,还是对ggplot2作图各种情况的处理,以及学习拼图。学习的时候也可以注意这些细节。

相关文章

网友评论

      本文标题:复现Science图表:细胞通讯受配体配对连线表达图(cellc

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/ikcjydtx.html