2019-08-01 安装Bioconductor及其中的包

Bioconductor简介

Bioconductor provides tools for the analysis and comprehension of high-throughput genomic data. Bioconductor uses the R statistical programming language, and is open source and open development. It has two releases each year, and an active user community. Bioconductor is also available as an AMI (Amazon Machine Image) and a series of Docker images.

Bioconductor提供分析和理解高通量基因组数据的工具。 Bioconductor使用R统计编程语言，是开源和开放式开发。 它每年有两个版本，还有一个活跃的用户社区。 Bioconductor还可用作AMI（亚马逊机器映像）和一系列Docker映像。

Bioconductor的官网为：Bioconductor - Home。
截至2019年8月1日为止，Bioconductor的最新版本为3.9，共包括1742个软件包。

Bioconductor的安装步骤

安装步骤见：Bioconductor - Install

其中，关键的命令为：

 if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
 install.packages("BiocManager")
 BiocManager::install()

注意，要在R命令里面进行上述命令的安装。

如果想安装具体某个包，比如Biobase：

  BiocManager::install("Biobase")