关于Mac aspera的问题，困扰了几个月。
1.没有此目录
解决办法：添加环境变量
2.string not in pwd
找了很久，这样可以解决：
/Users/apple/Applications/Aspera\ Connect.app/Contents/Resources
添加一个转义字符\，解决啦，开心！！！
3.NCBI连接不上去，加了端口也没用
好吧，转战NGDC，和ncbi命令行差不多
/Users/apple/Applications/Aspera\ Connect.app/Contents/Resources/ascp -P33001 -i /Users/apple/Documents/test/aspsub_rsa -QT -l100m -k1 -d /Volumes/Tan/raw/aspsub@submit.big.ac.cn:uploads/xxxxxxx@qq.com_5404ea8d/GSA/
NGDC填写文件太烦了，尤其是那个md5码，一下子填了600多个伤不起，难免和文件对不上，有几个文件就会验证失败。2T多的数据保守估计要传六天左右，真是崩溃。
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上传测序数据到SRA数据库。参考链接1aspera的使用1.注册NCBI账户2.https://submit.nc...
目录 测序数据的获取：SRA数据库，数据下载软件Aspera 格式转换：SRAToolkit 一、测序数据的获取 ...
惭愧，文章拖了这么久又有重新审稿了，之前的编辑挺看好的，结果2020年年底闭刊了，编辑觉得还有问题需要修改，来不及...
最近，需要上传数据到NCBI，因为数据量有2T左右，所以考虑用aspera。但是报错如下： （1）其实NCBI已经...
生物或医学中涉及高通量测序的论文，一般会将原始测序数据上传到公开的数据库，上传方式见测序文章数据上传找哪里；并在文...
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下载安装 下载链接获取 已知文章中所用数据的BioProject number: PRJNAxxxxx 进入htt...
在SRA上传数据，较大的文件，直接http上传容易断点，一般会使用Aspera connect进行上传。以wind...
ascp/aspera对于生信中较大数据的下载上传是非常快速的，谁用谁知道！像NCBI(GEO/sra)就是在用，...
本文标题：Mac下用aspera上传重测序数据遇到的坑
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/ikvnrhtx.html
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