Day5——youwanwan39

一些零碎的知识点

• R的赋值符号是 <-
• 在Console控制台输入命令，相当于Linux的命令行
• R的代码都是带括号的，括号必须是英文的
• 显示工作路径 getwd（）
• 向量是由元素组成的，元素可以是数字或者字符串
• 表格在R语言中改名叫数据框
• 使用代码要理解其中的命令、函数的意思（函数或者命令不会用时，出了百度/谷歌素搜索以外，还可以用？read.table，调出对应的帮助文档，翻到example部分研究一下）
• 数据类型有
  向量（vector） 矩阵（matrix） 数组（array） 数据框（data frame） List

向量

元素：指的是数字或者字符串（chr）等；
标量：一个元素组成的变量
向量：多个元素组成的变量
一个向量是一排有序排列的元素，以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。
使用时，一般会给变量赋值（数值、字符串、数据框等等）
x<- c(1,2,3) #常用的向量写法，意为将x定义为由元素1,2,3组成的向量
x<- 1:10 #从-10之间所有的整数
x<- seq(1,10,by = 0.5) #1-10之间每隔0.5取一个数（注意是逗号不是分号）
x<- rep(1:3,times=2) #1-3 重复2次

赋值

从向量中提取元素

（1）根据元素位置

x[4] #x第4个元素
x[-4] #排除法，除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4] #第2到4个元素
x[-(2:4)] #除了第2-4个元素的剩余 元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素

（2）根据值

x[x==10] #等于10的元素
x[x<10]
x[x %in% c(1,2,5)] #存在于向量c（1,2,5）中的元素

数据框

sep 指定字符的分隔符号
the field separator character. Values on each line of the file are separated by this character. If sep = "" (the default for read.table) the separator is ‘white space’, that is one or more spaces, tabs, newlines or carriage returns.
header 首行，header = T 即首行用作名称，否则为 header = F
a logical value indicating whether the file contains the names of the variables as its first line. If missing, the value is determined from the file format: header is set to TRUE if and only if the first row contains one fewer field than the number of columns.
colnames(X) 查看列名
rownames(X) 查看行名，默认值的行名就是行号，1,2,3,4……
colnames(X)[1]<-"bioplanet" 有的公司返回数据，左上角第一格为空，R会自动补为x，用这个命令来修改
X<- read.csv(file = "huahua.txt",sep="",header=T,row.name=1) 最后row.names的意思是修改第一列为行名
write.table(X,file="yu.txt",sep="",quote=F) 数据框的导出
save.image(file="bioinfoplanet.RData") 保存当前所有变量
save(X,file="test.RData") 保存其中一个变量
load("test.RData") 再次使用RData时的加载命令
X[x,y] 第x行，第y列
X[x,] 第x行
X[,y] 第y列
X[y] 也是第y列
X[a:b] 第a列到第b列
X[c(a:b)] 第a列和第b列
X$列名 提取列，支持Tab自动补全

with 把数据框或列表作为环境，可调用其中的对象

with(a,{
      plot(case,values)
x<<-summary(values)
})                   #求和并赋值给x，<<的意思是作为全局变量，也就是出了大于号仍有效

save(X,file="test.RData") 保存文件X，命名为test，文件后缀为RData