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[转]SuRF(SIGMOD 2018 Best Paper)

[转]SuRF(SIGMOD 2018 Best Paper)

作者: 贺大伟 | 来源:发表于2021-01-10 17:48 被阅读0次

    感谢作者,原文链接:https://www.sohu.com/a/255558996_775361

    SuRF获得了SIGMOD 2018 的最佳论文奖[1],必有独特之处,学习一下。

    在现在KV已经泛滥成灾的年代,随手写一个KV玩一玩也越来越流行了,但是真正能解决KV里面一些典型问题的并不多,SuRF很接地气,思路也很新颖。

    做过KV的同学都知道,bloomfilter索引[2]对于判断某个key是否存在是非常高效的,其能用极少的空间(与key长度无关),极低的出错概率判断key的存在性。

    但是对于range查询,比如Scan(begin = 'a', end = 'd'), 目前典型的做法还是基于树(B+Tree等),树结构易于理解、速度也比较快,但是太耗费内存,那么是否能有一种结构像树一样快(甚至更快),又占用很少的内存呢?抽象的说,这是本文要解决的核心问题。

    本文的思路是基于succinct data structure[3],将Tree或者说Trie进行合理的编码,从而在降低内存的同时保留查询能力(Succinct的核心理念),这样就在某种程度上将单key查询和range查询合二为一,做到了查询速度持平(甚至更快),且节约内存。

    先来看一下succinct data structure,这并非一个具体的数据结构,而是一个约束,即消耗的空间接近信息论下限且提供查询能力的数据结构。来自wiki:succinct data structure is a data structure which uses an amount of space that is "close" to the information-theoretic lower bound, but (unlike other compressed representations) still allows for efficient query operations。不过文中还特别强调其提出的Fast Succinct Tree本质上不算succinct,而只是compact,因为其空间耗费是O(Z),而Succinct要求Z+o(Z)。

    在Succinct思想的指导下,30年前Jacobson提出了一种Level-Ordered Unary Degree Sequence(LOUDS)的编码方式,该编码是理解SuRF的基础,简介如下。

    下面的介绍是从思路上介绍LOUDS,不会提到其中的操作如rank0/1,select0/1等,避免陷入细节中而忽略问题本身。让我们从最基础的开始想,对一个树,我们需要什么操作?父亲找孩子,孩子找父亲,广度或者深度遍历的表达式里面给一个位置找到节点,就是这么几个典型操作,对树编码后必须满足这些能力。LOUDS的编码方式有两个核心,一个是广度遍历,一个是节点编码等于孩子个数+0,比如下面图1,根节点2个孩子,编码110。为了下面方便说明,我们假设广度遍历后的编码序列是SS。抽象一点理解,在LOUDS编码序列SS里面,对任何一个位置,开始到该点的bit 0出现的个数表示前面有多少个节点,开始到该点的bit 1出现的个数表示前面的节点加上其直接孩子的节点。如图2示例,4前面有0 1 2 3四个节点,所以在编码序列SS中,4的编码(110)前面有4个0;也可以看到,在编码序列SS中,4的编码位置前面有8个1,所以节点4左边的节点以及其第一层孩子节点加起来是8(包括4或者-1不包括4)。在这种思想指导下,我们看看上面提到的树操作是否是容易被满足的。

    父亲找孩子:比如4如何找第一个孩子节点(9)?在编码序列SS中,4编码前面的bit 1出现次数表示4前面的节点以及其孩子节点的个数,这个值是8(从编码序列开头数1的个数到4的编码位置),然后我们又知道bit 0出现次数代表所有左边的节点个数,那么在编码序列SS里面找第8个0,边界处理下就可以了

    孩子找父亲:比如9找父亲节点(4)。类似父亲找孩子,只是反过来了,先看编码序列SS中9(0)编码位置前有8个0,表示9前面有8个广度遍历经过的节点,然后从编码序列开始数8个1,表示经过的节点及其直接子节点的个数,这时候也就找到了9的父亲

    编码序列里面的位置找节点:非常容易,看其前面有几个0就可以了

    我们可以看到succinct解决的核心问题是如何对树编码且保持基本操作能力,同时我们也看到,succinct是对结构进行编码,树里面放什么东西并不关心,比如对图1,树里面是否包含0138这个序列?上面的3个基本操作无法回答。这也是SuRF重点要讲的,即如何让将结构编码和内容搜索结合起来?

    假设内存无限,如何在庞大的字符串集合里面快速搜索到一个具体的字符串(想象一下搜索引擎的关键词提示)?trie是一个思路,第一层有256个字符,向下每个字符都有256个字符空间,在这个巨大的空间里面所有的字符串都包含,而且通过一次index就可以直接定位。我们很快会发现这样做不现实,因为第一层32B(bit编码),第二层32*32,第三层32*32*32...,内存消耗增长速度会非常快。常见的做法是空间压缩,如使用链表,而不是数组,这样那些不出现的序列就不会占用空间,这样整棵树就很接近上面LOUDS可以编码的结构了,再取一个byte数组DataArray记录广度优先遍历的每个节点的字符即可。这时候,比如我们要查0138,

    从根节点开始,发现0匹配

    找到根节点的孩子节点,到DataArray取相应的值,看看是否相等

    继续上面的流程,直到发现或者不匹配

    上面提示了两个极端,一个是全部使用trie,最快空间耗费最大,一个是全部编码,最慢(在一个巨大的数组里面反复跳跃查找也是很慢的)空间最小。那么能否结合呢?作者观察到字符串的前几个字符是高频的(很多key的共同前缀),应该采用裸trie方式,空间耗费可控,速度快;而后的字符可以采用LOUDS编码,节约空间。而且,文中还设计了一个R调节器,可以自由的控制两者的比例,从而在性能和空间方面达到最佳平衡。

    上面只是说了文章的核心思想,并没有完整的描述算法。从图2可以看到,LOUDS-Dense是用空间换时间的部分,而LOUDS-Sparse是时间换空间的部分,具体的细节数据结构都是为了工程实现的,略过。

    上面说到了tune,其实除了这个最大的tune因素R之外,还有不少,比如使用look-up table,预取部分字段,为每层保留iterator;比如字符太长,可以截掉中间的部分将尾部放上来,因为尾部更有区分性,比如将字符的hash放到尾部等等细节问题,作者也做了较好的profile。

    试验结果分两个部分,一个是基于RocksDB,100G数据做开放和封闭搜索(是否指定结束位置),有1.5到5倍的提升;二是和其他数据结构的对比,见下图,比较有意思的是,C-ART(CompressedAdaptive Radix Tree)和FST(Fast Succinct Tree,本文方法)始终很接近(10%差别可以tune出来,best大概是授予这种新思路),当然,他们都比另外的好太多了。

    欢迎纠正、讨论。

    [1]. https://sigmod2018.org/sigmod_awards.shtml

    [2]. https://en.wikipedia.org/wiki/Bloom_filter

    [3]. https://en.wikipedia.org/wiki/Succinct_data_structure

    相关资料

    https://zhuanlan.zhihu.com/p/38385054

    https://zhuanlan.zhihu.com/p/38194127

    https://zhuanlan.zhihu.com/p/264173622

    https://zhuanlan.zhihu.com/p/31271788

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