命令行的方式使用TreeAnnotator

作者: 孟德尔的小豌豆007 | 来源:发表于2018-10-31 19:28 被阅读0次

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命令行的方式方便

Linux版本的BEAST2带的TreeAnnotator
用的Linux子系统，可以看Linux的windows10子系统 (WSL) 配置参考怎么配置子系统
-help参数可以查看可设置的参数
比如图形界面中参数这样设置的,我的树叫100rename.tree,在D盘

图形界面

对应的命令

cd /mnt/d
/mnt/d/BEAST.v2.5.0.Linux/beast/bin/treeannotator -burnin 10 -limit 0.5 -heights ca 100rename.trees outlinux.tree

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