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circos 可视化手册- fonts 篇

circos 可视化手册- fonts 篇

作者: 生信修炼手册 | 来源:发表于2018-05-12 13:46 被阅读9次

    circos中,fonts, colors, patterns这3个系统内置的block, 通过同一个配置文件引入,写法如下

    <<include etc/colors_fonts_patterns.conf>>

    这个文件的内容如下:

    通过include, 将color, fonts, patterns对应的3个配置文件分别引入。

    本章看下fonts相关的内容,etc/fonts.conf的部分内容如下:

    文件内容为key  = value的形式,key代表字体的名字,value代表字体对应的文件。

    对于字体文件,有以下两种格式

    1. TTF

    2. OTF

    在软件安装目录的fonts目录下,可以看到对应的字体文件

    ├── modern
    │   ├── Changes
    │   ├── cmunbbx.otf
    │   ├── cmunbi.otf
    │   ├── cmunbl.otf
    ..............
    │   ├── cmunui.otf
    │   ├── cmunvi.otf
    │   ├── cmunvt.otf
    │   ├── FAQ
    │   ├── Fontmap.CMU
    │   ├── Fontmap.CMU.alias
    │   ├── fonts.dir
    │   ├── fonts.scale
    │   ├── INSTALL
    │   ├── LICENSE
    │   ├── README
    │   └── TODO
    ├── README.fonts
    └── symbols
        ├── circossymbols.fog
        ├── circossymbols.otf
        └── circossymbols.png

    内置字体的效果可以参考以下链接

    http://circos.ca/documentation/tutorials/configuration/configuration_files/images

    下面的示意图是从这个网站截取的

    通常情况下,直接使用系统内置的字体就好。当想要自定义字体时,步骤如下

    1. 将字体文件拷贝到软件安装目录的fonts目录下

    2. fonts.conf文件中添加该字体的配置

    示例如下, 首先在etc/fonts.conf中指定新增的字体的名字和字体文件的路径

    mynewfont = /path/to/myfont.ttf

    circos.conf文件中,

    label_font = mynewfont

    即可调用新字体了。

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