讨论

1、先总结一些基本信息：

尽管柿子很重要，但是它的基因组还没有测。这个研究是柿树目测的第一个基因组。PacBio是三代测序，组装出基因组大小是849.53Mb，其中有94.14%挂载到了15条染色体上。预测了32516个基因位点和64.96%的重复序列，与其他物种进行了比较。

2、进化分析：

油柿在大约77.8Mya与猕猴桃分离，然后在100多年前又从拟南芥和葡萄家系中分离。柿子经历了一次WGD事件，柿树目的其他物种是否也是这样还有待研究。
KEGG和GO分析指出，基因家族的扩张主要是在淀粉和糖代谢中。口味涩的柿子比不涩的柿子更耐寒。因此，相关基因家族的扩展可能为柿子非生物抗性和生物抗性的产生提供了重要途径，这对柿子的进化和栽培扩展具有重要意义。
高密度连锁图谱是进行性状QTL精细定位、基因图谱克隆和标记辅助育种的基础。
二倍体油柿是六倍体柿子的祖先之一。

总结下来，对柿树目的第一个基因组（油柿）进行了测序，发现其大小约为849.53 Mb ;其中94.14% (799.71 Mb)的序列能挂载在15条染色体上。比较基因组学分析揭示了柿子在低氧反应中乙醛的产生引起的涩味产生(PA合成)和去除的遗传基础。构建了第一份柿子遗传图谱，表明油松是栽培柿子的祖先之一。柿子基因组代表了一种宝贵的资源，为水果的遗传改良和更好地理解其基因组进化。利用该基因组序列可开发遗传标记，为加快柿子育种奠定基础。
The persimmon (Diospyros oleifera Cheng) genome provides new insights into the inheritance of astringency and ancestral evolution