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准备工作----单细胞数据检测SNV与多组学分析
准备工作----单细胞数据检测SNV与多组学分析
作者:
单细胞空间交响乐
| 来源:发表于
2024-09-16 12:24 被阅读0次
作者,Evil Genius
我们的单细胞空间外显子分析课程已经开始了,欢迎大家报名,多组学是分析的潮流,也有助于我们深刻的认识生物学问题,甚至于找到解决问题的方法,单一组学都有局限性,一叶障目并不可取。
中秋节,好好玩。
检测突变最直观的结果就是,直接识别恶性肿瘤细胞。
从单细胞检测数据中获取SNV信息,注意这里强调的是从单细胞 3‘数据中获取突变信息。
完整的分析示例图如下,单细胞表达数据联合突变检测的分析
我们可上讲过了,scRNA的比对是通过star软件进行的,参考基因组一般是hg38,一般会形成bam文件,而我们的单细胞突变信息就是从bam文件中获取的。
甚至我们需要结合SNV和CNV进行分析
各种单细胞识别SNV的方法层出不穷
检测每个细胞的突变情况
生活很好,有你更好
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准备工作----单细胞数据检测SNV与多组学分析
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