在使用Seurat进行单细胞分析时,使用FindNeighbors函数功能时,出现下面的报错
Error in validityMethod(as(object, superClass)) : object 'CsparseMatrix_validate' not found
这是Matrix
这个包有问题,需要更新Rtools,并重新装载Matrix
这个包,具体可执行下面的方法
install.packages('installr')
library(installr)
install.Rtools()
install.packages('Matrix')
library(Matrix)
然后退出R重新运行就可以正常使用Seurat中FindNeighbors函数功能
参考文章
object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found
https://github.com/satijalab/seurat/issues/6746
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