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报错处理——object ‘CsparseMatrix_vali

报错处理——object ‘CsparseMatrix_vali

作者: 生信小鹏 | 来源:发表于2023-03-22 21:57 被阅读0次

    在使用Seurat进行单细胞分析时,使用FindNeighbors函数功能时,出现下面的报错

    Error in validityMethod(as(object, superClass)) :    object 'CsparseMatrix_validate' not found
    

    这是Matrix这个包有问题,需要更新Rtools,并重新装载Matrix这个包,具体可执行下面的方法

    install.packages('installr')
    library(installr)
    install.Rtools()
    install.packages('Matrix')
    library(Matrix)
    

    然后退出R重新运行就可以正常使用Seurat中FindNeighbors函数功能

    参考文章
    object ‘CsparseMatrix_validate‘ not found
    https://github.com/satijalab/seurat/issues/6746

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