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vmd解决分辨率问题

vmd解决分辨率问题

作者: kkkkkkang | 来源:发表于2020-04-06 16:21 被阅读0次

    已知蛋白序列,预测出其三维结构,并把此蛋白定向进化突变的关建氨基酸位点凸显出来
    vmd可以实现,但是输出的图片分辨率较低,不符合文章投稿要求
    通过查看vmd帮助文档,解决方法如下:

    1. 这里我已经获得了预测的蛋白三三维结构文件 — .dat结尾;首先利用vmd的Tachyon渲染器输出一个.dat文件

    2. 命令行模式下转化为高分辨率bmp格式

    C:\Program Files (x86)\University of Illinois\VMD>.\tachyon_WIN32.exe C:\Users\yjk\Desktop\ruan\1.dat -aasamples 36 -mediumshade -trans_vmd -res 1920 1080 -format BMP -o C:\Users\yjk\Desktop\ruan\1.bmp
    Tachyon Parallel/Multiprocessor Ray Tracer   Version 0.99.1
    Copyright 1994-2014,    John E. Stone <john.stone@gmail.com>
    ------------------------------------------------------------
    Scene Parsing Time:     5.9690 seconds
    Scene contains 548110 objects.
    Preprocessing Time:     0.4370 seconds
    Rendering Progress:       100% complete
      Ray Tracing Time:    35.7190 seconds
        Image I/O Time:     0.0470 seconds
    
    1. NB: -aasamples 一般设置为24,值越大锯齿越不明显,但不能无限大
      -res 调节分辨率

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