本内容为【科研私家菜】生信数据库系列课程
R小盐准备介绍那些小众又好用的生信数据库
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今天R小盐介绍的数据库是 疾病负担数据库(GBD: global burden of disease)
01 GBD疾病负担数据库
GBD,global burden of disease(全球疾病负担),该数据库每年都会更新,目前已经更新到GBD2019。GBD数据库包含所有GBD疾病、风险、病因、损伤、自然损伤和后遗症综合征。
由来自156个国家和地区的7000多名研究人员组成的联盟收集和分析了这些数据,从1990年到现在,这些数据按年龄和性别记录了来自195个国家的350多种疾病和伤害的过早死亡和残疾情况,从而可以对不同时间、不同年龄组和不同人群进行比较。GBD 机制的灵活设计允许随着新的数据和流行病学研究的提供而定期更新。通过这种方式,这些工具可以在全球、国家和地方各级用来了解随着时间推移的健康趋势,就像国内生产总值数据用来监测一个国家的经济活动一样。
GBD涉及的内容内容包括:
所有 GBD 的原因,风险,病因,损伤,伤害的性质,人口估计,生育率估计,和生命表
测量方法: 死亡率、寿命损失年数(yls)、残疾寿命年数(yld)、残疾调整寿命年数(DALYs)、患病率、发病率、预期寿命、健康预期寿命(HALE)、孕产妇死亡率(MMR)和总暴露值(SEV)
指标(单位) : 数量,比率,百分比,年龄,死亡概率
年份: 1990-2019; 所有指标的年度结果
所有 GBD 年龄组
性别: 男性,女性,两性
地点: GBD 超级地区,地区,国家,选择次国家单位,和定制地区(世卫组织地区,世界银行收入水平,等等)
02 GBD疾病负担数据库
GBD 研究包括特定疾病或危险因素的流行率及其造成的相对危害。这些工具使决策者能够比较不同疾病的影响,如疟疾和癌症,然后在家中使用这些信息。为了使这些结果更易于理解和使用,IHME 将大量复杂的信息提炼成一套交互式数据可视化,使人们能够理解生成的超过10亿个数据点。
03 GBD Data Visualizations
https://www.healthdata.org/gbd/data-visualizations
https://www.healthdata.org/data-visualization/gbd-compare
在这个树图中分析1990年至2019年期间369种疾病和伤害以及87种风险因素的世界卫生最新估计数。使用地图、树图、箭头图和许多其他图表来比较一个国家内部的原因和风险,比较不同地区或世界的国家,探索不同国家、年龄和性别的模式和趋势。国家以下一级的成果也可供选定的国家使用。从全局视图向下钻取到特定的细节。比较预期和观察到的趋势。观察疾病模式是如何随着时间而改变的。了解哪些死亡和残疾原因影响更大,哪些正在减弱。
数据库引用:
Institute for Health Metrics and Evaluation (IHME). GBD Compare Data Visualization. Seattle, WA: IHME, University of Washington, 2020. Available from http://vizhub.healthdata.org/gbd-compare. (Accessed [INSERT DATE])
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