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2022-09-07 Error in getAnnotatio

2022-09-07 Error in getAnnotatio

作者: 学习生信的小兔子 | 来源:发表于2022-09-06 21:47 被阅读0次
#在运行下面的代码的时候报错了
chipObj <- ChIPQC(samples, annotation="hg38")
Error in getAnnotation(annotation, AllChr = chromosomes) : 
  object 'TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene' not found

#解决方法 先安装一下这个包 再运行就没报错了
BiocManager::install("TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene")
library(TxDb.Hsapiens.UCSC.hg38.knownGene)
chipObj <- ChIPQC(samples, annotation="hg38")

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