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R安装包的镜像设置

R安装包的镜像设置

作者: 淡水鱼Ada | 来源:发表于2020-02-18 19:50 被阅读0次

    这样设置镜像,在安装R包的时候速度提快了不少呢!
    options("repos"=c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
    options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")

    第一行CRAN库中包的镜像,第二行是Bioconductor中包的安装镜像的代码设置。

    参考:https://www.jianshu.com/p/6891c2257774
    小洁忘了怎么分身--三言两语讲基础:镜像与隐藏文件

    一个待解决的问题:

    我试图安装BiocManager::install("clusterProfiler"),但是在控制台中一直提示连接失败,如下图所示。


    image.png

    我也不清楚问题出在哪里了,然而目前暂时没有时间去查找为什么会发生这种情况,我就在脚本中,用代码的方式设置了R安装包的镜像,结果非常好,安装上了。
    这是一个遗留的问题。

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