当直接run某个.py文件，而这个.py文件中有诸如：
from . import x
from .. import y
的导入语句时，就会报上述相对路径错误。
根源可归结为下面一句话：
Relative imports use a module’s name attribute to determine that module’s position in the package hierarchy.
也就是说，相对路径是根据当前module的名称属性来决定所导入的相对模块的位置的。
首先我们回顾一下绝对导入（即导入时的module名不以.开头）的搜寻路径（python 2.7文档6.1.2 The Module Search Path有详细阐述）。
1、built-in模块
2、在sys.path指定的目录中查找。sys.path在启动python解释器时按照下面的顺序初始化
a、当前运行脚本所在的目录
b、PYTHONPATH（即标准库，类似于'C:\\WINDOWS\\SYSTEM32\\python27.zip', 'C:\\Python27\\DLLs', 'C:\\Python27\\lib', 'C:\\Python27\\lib\\plat-win', 'C:\\Python27\\lib\\lib-tk', 'C:\\Python27',）
c、安装依赖的一些缺省值（类似于C:\\Python27\\lib\\site-packages）
你可以在代码中修改sys.path的值来改变搜寻路径，比如sys.path.append( "/specified/path"），当然也许你想将这个特定的搜寻路径放在sys.path的开头，这样具有更高的优先级，可以这样做sys.path.insert(0, "/specified/path")。
话说回来，相对导入是根据当前module的名称属性来决定所导入的相对模块的位置的，也就是根据当前module的__name__属性来计算相对导入模块的位置，如果你直接运行module.py(a.k.a python module.py)，那么当前module.py的__name__属性值为"__main__"（比如你经常在其中添加 if __name__ == "__main__": do_something())，显然根据"__main__"来计算相对路径肯定得不到你想要的结果。
假设如下的代码层次结构：
package/
__init__.py
subpackage1/
__init__.py
moduleX.py（from .. import moduleA）
moduleA.py
run.py （import package.subpackage1.moduleX）
如果python run.py，则运行到moduleX中时，moduleX的__name__属性值就是package.subpackage1.moduleX，这时根据导入，会得到package.subpackage1.moduleX..moduleA，即package.subpackage1.moduleA也是准确的。
简而言之，当你运行某个python文件时，这个python脚本最好处于你的代码的顶部（top-level），且该python脚本都采用绝对路径导入（因为该python脚本的__name__此时是"__main__"，仍无法使用相对路径）。在底层的目录中的python脚本就可以使用.开头的相对路径了。但要注意的是，为了采用相对路径能找到对应的module，目录中必须有__init__.py，这才会构造成一个package，即便__init__.py是个空文件！
一个绕过上述规则的方法（https://www.python.org/dev/peps/pep-0366/）： __package__. When it is present, relative imports will be based on this attribute rather than the module __name__ attribute。你可以在代码中这样写：
if __name__ == "__main__" and __package__ is None:
__package__ = "expected.package.name"
即明确为module指所属的package名称。
参考：
1、https://blog.csdn.net/qiusuoxiaozi/article/details/79061885
2、https://www.python.org/dev/peps/pep-0366/
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