ggpubr、nloptr包安装失败的解决方案——升级cmake

问题

在服务器的R中安装ggpubr包失败，查看报错日志发现，依赖的nloptr包安装失败。但单独安装nloptr仍然失败。

解决过程

1. 在服务器上安装nlopt（注意不是nloptr，而是单独的一个程序），参考nlopt的官网https://nlopt.readthedocs.io/en/latest/NLopt_Installation/，下载v2.7.1.tar.gz，按照说明安装

cmake . && make && sudo make install

然而发现系统的cmake版本过低，nlopt需要3版本的cmake，而服务器上的cmake是/usr/bin/cmake，版本是2.8.12.2. 所以又下载了cmake，使用cmake的绝对路径进行nlopt的编译，即

~/software/install/cmake-3.24.2-linux-x86_64/bin/cmake .

使用sudo权限，成功将nlopt安装到系统目录，在/usr/local/lib64中可以看到libnlopt.so libnlopt.so.0 libnlopt.so.0.11.1 这些文件。然而，重新安装nloptr包还是失败。

（中间根据其他人的帖子，尝试安装libnlopt-dev，我们服务器的unix是redhat版本，没有apt。使用yum install也找不到libnlopt-dev，虽然在centos的rpm包官网上能找到libnlopt-dev，将其下载到本地，用yum localinstall命令安装这些包，但仍然失败。）

2. nloptr的安装信息中提示cmake出错。于是猜想，可能是nplotr在编译过程中用的还是系统中2版本的cmake，所以我在.bashrc文件中将3版本的cmake添加到PATH中。然后使用“which cmake”查看cmake的路径是否3版本的cmake。然后再次安装nplotr，成功。继而安装ggbubr，成功。

export PATH= ~/software/install/cmake-3.24.2-linux-x86_64/bin/:$PATH

小结

安装3版本的cmake，并将其添加至环境变量，可成功安装nloptr包，进而可成功安装ggpubr包。