1 打开网址
2 选择细胞系和组蛋白,进入基因组浏览器
image.png3 看峰
image.pngimage.png
4 去NCBI下载序列
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/gdv/browser/?context=genome
输入坐标:
image.png
image.png
得到序列:
>gi|568815587|ref|NC_000011.10|:117987686-117988171 Homo sapiens chromosome 11, GRCh38.p12 Primary Assembly
AGAGTAGAGCTAGGAATTGGTATTGAGTATCTCTCCTCGGAGCTACAGGTGCCAGCTCTTGTGGGGATGT
CCTCAGCCATGTGTAGAGCCAGAGCTGATTTATTCCATCTGTCCTTGCCCAGCCAGAGGTTGGACATCTG
GCTATAGGCAAAGCCCTCCCAGAAACTAGGGAATGAGGCAAGCACTTAGCTTGGGGAGCCCAGGAGACCT
ATGAAGAGAAGGAGGCAGATGTCAGCAAGCAGGCTGTCTGTGTACTTAGTGAGGTGGCTTTGAGCTGGAG
CCTGGGCCAAGCCAGGGTGGGGATCAGGTGTGTGGATGGGGCCAAGCCTAGGAATAGTGCTAGAGCAGGG
ACAGGGATTGGGCAGAGCCAGGGACTAACACATCTGAGAGCTCATTGCCAACTTGCTTAGCCCTCGGCCC
CTGCCTTCTTCCCTGGTAGGCATCAGACTCAGCTTGGCTCTTCTCAGCCCCCACTGCAGCTTCTGA
注意如果基因是在反向序列上,则要取互补序列。拿到序列去设计引物,进行chip-qPCR。
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