葛洲坝、三峡大坝等大坝的建成，使原来连续的河流生态系统被分割成多个独立的区域，使得鱼类洄游通道被阻隔，这对在进化史中形成的需要通过大范围、长距离迁移的的鱼类造成极大的影响。
据统计，在长江三峡截流之前，三峡江段原有鱼类共有108种，但是随着大江截流和正常蓄水之后，共有约40种鱼类由于河流生态环境的改变而受到影响，其中就包括了约40%上游特有的鱼类。这其中有没有观察到产卵的中华鲟。
人们采取了一系列措施。珍稀特有鱼类驯养救护中心、修建珍稀和特有鱼类自然保护区、增殖放流以及生态调度试验制造“人造洪峰”促进中下游包括“四大家鱼”在内的鱼类自然繁殖等方式来维护长江流域鱼类种族规模。
常剑波说：“长江有190种特有鱼类，其中90%在上游。水库可能使某些种类增加，但会侵害特有种类，不利于生物多样性的保持。”
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