Ubuntu18.04 快速安装Bio::Perl

作者: 煮梦斋_bioinfo | 来源:发表于2020-05-28 19:35 被阅读0次

Bio::Perl里边包含的module太多了，我尝试用cpanm Bio::Perl与直接从source下载tar包均报错且无法解决相关的依赖问题，用cpanm --force安装后仍然无法使用。
最后，我发现ubuntu系统有自带的Bio::Perl，安装后可用：

sudo apt-get update
sudo apt-get install bioperl

大概大几百M，安装时有个报错

libdvd-pkg: `apt-get check` failed, you may have broken packages. Aborting

可以通过下面的语句解决

sudo dpkg-reconfigure libdvd-pkg

再次运行

sudo apt-get install bioperl

至此Bio::Perl可以使用了
注：本方法针对的是使用ubuntu自带Perl的童鞋。

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