正常说，这二者不可比。但现代人们有着烙印一般的观念，崇尚科学，批判一切非科学。也就这几百年，人类形成的一种根深蒂固的同分妄见。其实，科学从来也就没有超出相的范围，无论哪种科学都是在说相的故事。就算所谓的哲学，探讨的是事物的变化规律，也是相上的事。跟佛的思想不在一个纬度，《金刚经》一句话说明白了，“凡所有相，皆是虚妄。”当然，若这样说，没人会服气，会相信，反过来会嘲笑，会鄙视，会更加自以为是。
我有个8岁的孩子，每次看到彩虹都会欢呼雀跃，无比兴奋。“快看！彩虹！”。有一次，我告诉他，彩虹实际上是光的折射。光本身只是光，真的会有颜色吗？只是你把它看出了颜色，还把它叫做彩虹。孩子没有再问什么，因为他完全没听懂我的意思。
但作为希望探求真相的思索者，我们应该去思考，我们看到了红色，光本身是红色吗？还是我们意识中它是红色？为什么色盲看到的就不是红色？为什么其他动物看到就未必是红色？事实上，人类完全不知道动物是否认为这是红色，只能做实验看它们能否区分这种色彩。光，其实是一种波动，一定的频段能被我们感受成色彩，一定的频段能被我们感受成声音，还有许多频段我们无法感知。我们由感知所升起的认识并非光的本身，或说并非是真实的光。但我们仔细区分，并加以命名，赤橙黄绿青蓝紫。最最严重的是，我们认为这就是真，而忘记了光的本身。佛说，这是“分别留影”，就是外界事物在人的意识中的影像，我们去区分分别。
进一步说。我们看到的光，光的本身谈不上有颜色或没颜色，是人类的感知系统把它感知成了色彩。为什么感知成了色彩？这是生物进化造成的。如果光会灼伤人，没准你看到的光就成了火。我们眼里的真实并不是事物的本身，只是我们的意识分别。而我们的意识分别只有非常薄弱且无常的生物基础，在认识真实事物时反是我们巨大的障碍。这就是那则寓言的意义，阿难说佛的胳膊是正是倒，佛说胳膊没有正倒，只是众生颠倒想象。
再举个例子。你手里拿着一个杯子，这个杯子真实存在吗？你不可能怀疑这种事，除非自己是疯子。但如果你的眼睛能看到分子原子，你就不会这么想了。杯子是一大团分子原子聚合而成。按现在的科学理论，每个原子有个很小的核，核与核之间相距很远，期间有稀薄的电子云。你觉得你拿着杯子，可事实上，你手上的原子距离杯子上的原子很远。它们之间电子云的排斥力使彼此挤压。这一切只是因为人类的感知尺度狭小，才让你认为你拿着一个杯子，但这并非事实。
无论是光还是杯子，这里没一句话是反科学的，只是对事物认识的思辨而已。无论是佛的思想还是科学的探究，都只为认识世界的真相。佛的思想和如今的科学走的是两条不同的路，佛要破除世间相的障碍，直至源头。科学在世间相中不断回溯，也在追寻源头。尤其是物理学，是一门研究上帝是否存在的学问。真相只有一个，两个就是谬误。所以，任何一种探究方式，只要是正向的，是朝向真理的，不是背道而驰的，他们离真理越近，他们彼此就越靠近，真理就是他们的交点。
我读过一些经书，有时非常的感动。《圣经》、《佛经》、《道德经》虽说语言不同，文化背景不同，但他们都说出了同样的真实。我们后人很多没读懂，又受世代观念束缚，弄出那么多门派宗教。世人攀缘著相之心顽固不歇，以妄为正。
科学的方向是正确的，但是是受障碍的。这个障碍就是人类自身的感官。每次当突破了人类的障碍，科学都会进一大步。望远镜发明，让我们知道有浩瀚无垠的宇宙。显微镜发明，直至电子显微镜，原子力显微镜，让我们能看到纳米世界。这都延伸了人类的视野。深水潜艇，宇宙飞船，让我们能走得更远。爱因斯坦相对论，终于突破了人对时空的观念，科学因此前进一大步。从这个意义上来说，科学的进步就是在破除人类的相，人类固有的局限的意识。所以，如来说，一切法，皆是佛法。科学可以说是佛的护法呀！佛是要破相的，科学就从相上一点一点地破相。
佛的思想直接站到一切障碍之外，所以在2500年前他就有许多不可思议的思想，不断地被现代的科学所证明。我们最熟悉的“三千大千世界”，佛陀说宇宙中还有无数无量的世界。又说，世界可碎为微尘，可以很多级的细分下去，直至虚空。这与道家的“观大无外，观小无内。”相合，也是现代物理学的物质观。我们现在说“世界”，这是佛经里的词，“世”代表时间的流转，“界”代表四维空间。“世界”就是指时空，这就是2000多年后爱因斯坦说的时空。佛经中说过，天人的时间和凡人的时间不同，天上一天，凡间一年。这是佛经里相对论的影子。佛经说四维时空是重叠的，这是什么意思？还没人懂，但有些疯狂的物理学家正在设想多维空间的卷曲重叠。佛说，阿那律尊者（眼睛瞎了，但开了天眼）观阎浮提（也就是我们的世界）就像在手上看一个小果子。“小果子”！2500年前至少佛知道地球是圆的，他没说是小饼子，小方块，小石子。菩萨可以看十方佰仟界，而佛就是了无障碍，于一毛端现无量佛国土。佛经还描述了地球表面大多数是海洋，有大洲，有岛国的景象。佛陀，乔达摩•悉达多，是没有离开过印度的，即便是从当时的书中也无法获取这些知识。这要等到大航海时代，中国的明朝前后才有的知识。佛经说一切源于妄动，最初的振动。为什么是妄？妄就是没有为什么，有为什么就不叫妄。这在物理学里，就代表一种高能态，不稳定，会变化。佛经说最先有的是振动。事实就是如此，能量以波的形式存在，可以聚为物质显现离子性，又可以像光一样，显现波动性。佛陀的时代没有那么多现代科学的概念，他描述了几千年后人们才认识到的事物，令人叹为观止！
这种高超的智慧就是佛陀圆觉的证明。若在世为人，应追求光明智慧，去除烦恼疑惑，那么好好学习佛经。
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