建立索引 序列比对 --readFilesIn :paired reads文件--outSAMtype :表示输出...
数据下载 sra下载ncbi数据 star 比对 star软件的简单使用star官方文档 gatk流程
比对软件STAR使用说明 Spliced Transcripts Alignment to a Reference...
在之前的学习和练习里,比对这一步我使用过bowtie2(DNA比对)和hisat2(RNA-seq比对),现在学习...
STAR 软件安装 软件的GitHub地址为https://github.com/alexdobin/STAR, ...
最近使用了另一个很火的比对软件:STAR。STAR在比对速度上胜过其他比对器50多倍,在一个普通的12核服务器上,...
一般对于DNA数据,比对软件一般使用:bowtie2、bwa 对于RNA数据,比对一般使用:hisat2、star...
最近使用STAR比对出现了状况,软件版本和对应的Index不相容,报错信息如下 原因是之前构建好的index是使用...
Hisat2与STAR一样,是一款比对软件。它使用了基于BWT和Ferragina-manzini (Fm) in...
首先,先回顾一下STAR的使用流程: 安装最新版本的STAR可以使用conda 但是当我使用最新版本的STAR跑之...
本文标题:STAR软件使用
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