美文网首页
MEGAN使用报错:Exception in thread "m

MEGAN使用报错:Exception in thread "m

作者: 轻枫柳曳1208 | 来源:发表于2020-04-07 15:56 被阅读0次

    MEGAN 转换daa文件为rma文件时报错

    报错信息为:

    10% 20% 30% Exception in thread "main" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space 
    at megan/megan.accessiondb.AccessAccessionMappingDatabase.getValues(AccessAccessionMappingDatabase.java:236)
            at megan/megan.rma6.RMA6FromBlastCreator.parseFiles(RMA6FromBlastCreator.java:265)
            at megan/megan.tools.DAA2RMA6.createRMA6FileFromDAA(DAA2RMA6.java:350)
            at megan/megan.tools.DAA2RMA6.run(DAA2RMA6.java:313)
            at megan/megan.tools.DAA2RMA6.main(DAA2RMA6.java:68)
            at megan6u/megan6u.tools.DAA2RMA6.main(Unknown Source)
    

    参考网址

    http://megan.informatik.uni-tuebingen.de/
    在MEGAN社区网站上将错误信息输入,得到的解答是内存分配的不够。
    最低内存16G,越大越好

    修改方法

    将安装包中的MEGAN.vmoptions文件中的-Xmx参数进行修改
    默认值是-Xmx2000M
    我修改成了-Xmx5000M,700M的数据,5分钟左右,就转换完成了。
    修改完成的文件内容如下:

    # Enter one VM parameter per line
    # For example, to adjust the maximum memory usage to 512 MB, uncomment the following line:
    # -Xmx512m
    # To include another file, uncomment the following line:
    # -include-options [path to other .vmoption file]
    #-Xmx2000M
    -Xmx5000M
    

    相关文章

      网友评论

          本文标题:MEGAN使用报错:Exception in thread "m

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/lbjnphtx.html