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Zotero高效云管理文献

Zotero高效云管理文献

作者: rx_rx | 来源:发表于2020-04-17 11:38 被阅读0次

zotero是一款文献管理软件,具有如下优点:

  • zotero程序是免费并且开源的,托管到github,支持个人完善文献的导入导出接口

  • 支持window、linux、mac等操作系统

  • 支持Chrome、firefox、Safari等浏览器插件,可以直接从网页添加文献条目,并自动下载可使用的pdf文档

  • 对添加的pdf文献,自动抓取其中的元数据并形成文献条目

  • 利用相应插件,可对pdf文档可实现自动重命名并放置在相应文件夹

  • 支持Office word的文献插入,支持输出bib文件

zotero的安装和注册

  1. Zotero官网下载并安装,注意是左侧的独立版,该独立版包含了chrome插件,后期会自动安装。
  1. Zotero官网进行注册,用于后续的文献云管理,及多台设备间的同步

  2. 打开Zotero软件,并登陆上述的注册账号

Zotero+坚果云实现文献云管理

当存在多台设备,并希望实现文献管理同步时,zotero提供的免费300M云空间显得不够用。不妨借助坚果云盘 实现多台设备间的文献库同步。

坚果云盘可以监视文件夹的变化,并进行更新同步,其免费版提供每月1GB的上传量、3GB的下载量,完全满足日常阅读文献量,而且上传下载速度可以达到1MB/s,个人感觉是国内首选云盘。而且自2019年,Zotero直接支持基于坚果云盘的文件同步功能。

目前有两种方法可以实现利用坚果云盘同步文献库:

  1. 直接利用坚果云的WebDAV功能在zotero进行关联设置,

  2. 通过Zotfile插件自定义文献库的存储地址并利用坚果云对此存储地址进行监视。

这两种方法各有利弊,并且由于历史原因,本人主要通过第二种方式进行文献同步。

坚果云下载及账号注册:坚果云官网

利用坚果云的WebDAV功能实现文件同步

打开坚果云官网并登陆刚刚注册的坚果云账号,依次点击账号名称 -> 账户信息 -> 安全选项 -> 第三方应用管理 -> 添加应用密码,我的应用名称为zotero

打开zotero软件,依次点击Edit -> Preferences -> Sync,并在File Syncing 位置填写坚果云官网上对应的信息,并最后点击Verify Server按钮

利用Zotfile插件对文献文件进行重命名及存储地址

Zotfile的下载地址和具体使用介绍参见ZotFile 或者GitHub - jlegewie/zotfile

我的文献文件统一存放在D:\literature\papers-data,并且统一命名为作者名-年份-标题,具体设置如下:

  1. 将下载的zotfile的zip源码包的后缀,由.zip 改为.xpi

  2. 打开zotero软件,并依次点击Tools -> Add-ons,并选择Install Add-on From File...,安装上面的.xpi 文件

  1. 重启Zotero软件

  2. 依次点击Edit -> Preferences -> Advanced -> Files and Folders,把base directory修改为文献存放目录

  1. 依次点击Tools -> Zotfile Preferences,进入Zotfile的设置界面:分别设置文件存储地址、命名规则、监视文件类型等,我的设置如下

    设置文献存储地址,及检测某个文件夹内的新的文献(可配合chrome的默认下载地址):

配合iPad或者Android设备使用

文献重命名规则,我的设置规则为第一作者的名字-年份-标题的前50个字符

设置文献的文件格式,扩展了caj、jpg、ppt、pptx、txt等

  1. 打开坚果云,并将文件夹D:\literature\papers-data设置为同步文件夹

经过上述设置,即可利用zotfile插件对zotero添加的文献文件自动移动到D:\literature\papers-data 并进行重命名,并且利用坚果云实现此文件夹的监视和同步,当多台设备都进行此项设置时并统一登陆账号时,即可实现文献管理同步。

Zotero的其他插件

  • Zotero Memento:自动检索作者ORCID配置文件,用永久的DOI url替换所有容易链接失效的链接等

  • Zotero Scholar Citations:相较于endnote,zotero的一大遗憾无法显示文献的被引次数,这个插件适当的进行了弥补,基于谷歌学术添加被引次数,注意,当短时间内多次使用时,可能引发谷歌学术的机器人判定验证,此时再使用此插件所获得的被引次数直接为0,经历一段时间,会恢复。

  • Zotero DOI Manager:自动下载、核对DOI,支持shortDOI、longDOI格式(本人习惯使用longDOI,以配合sci-hub使用)

  • Better BibTex for Zotero:提供更好的bib输出,配合LaTeX使用

zotero官网汇总了多种插件zotero-plugins,包括官方开发和第三方开发,可根据个人需求进行安装。

各类网站正常抓取元

使用zotero过程中,主要使用 网页识别pdf文件导入 两种方式导入文献:

  • 网格识别是直接识别谷歌学术、期刊网站、维基百科、豆瓣等网站的网页内的数据元,包括标题、作者、年份、简介、关键词、DOI等,形成文献条目;

  • pdf文件导入,识别文献pdf中的数据元形成文献条目,近几年的文献pdf中一遍都嵌入了相关格式的数据元。

不过pdf文件导入形成的文献条目的信息有限,优先使用针对期刊网站的网页识别方式。

GitHub - zotero/translators: Zotero Translators提供了对于各类网页的抓取元数据的格式文件,当某些网页无法正常抓取时,可从这里下载最新的.js 文件,替换到本地zotero目录下的translators文件夹内,可通过Edit -> Preferences -> Advanced -> Files and Folders 查看文件夹translators所在目录。

还支持个人编写translator,以更精准的从各类网页、刊物网站进行文献导入

对于一些中文网站,包括bilibili、中国知网、百度学术、万方等,为了更好的抓取元,可从GitHub - l0o0/translators_CN 下载第三方的.js 文件,并添加到文件夹translators

另外,经上述设置后,在抓取中国知网的文献时,往往作者的姓与名是分开的,并且文献文件的自动命名也无法显示全部的姓名,这是不符合国人习惯的,并且也不利于文献管理,可参考青椒学术的Zotero Connectoxir保存知网文献时,如何解决作者的“姓”和“名”分开抓取的问题? ,下载他提供的CNKI.js文件覆盖到本地,此时从知网添加的文献条目中,中文作者的全称显示在了AuthorLast位置,而first位置空缺,此时可避免上述问题。不过看着first位置空缺,影响美观,期待有人对此再调整一下。

引用文献格式

zotero提供了多种文献参考样式,目前可选择的文献格式有9731种,可根据期刊要求进行选择,并支持个人编写citation style,以满足更多的各种文献引用格式。

设置Sci-Hub为pdf解析库

参考自Zotero搭配Sci-Hub,真香! - 简书

在添加文献条目时,支持该文献的pdf下载(比如,所在单位购买了该数据库,并且本人具有权限)或者为Open Access期刊,则可以直接自动下载并完成归档,但是大部分的文献都是付费形式的。而Zotero得默认pdf解析库则无法取得可用得pdf。

不过,zotero具有很强得个人定制能力,允许个人根据自己得喜好自定义pdf解析器(custom PDF resolvers),这就给了我们机会,将zotero的pdf解析库指向sci-hub,从而获取大部分文献的免费自动获取能力。

依次点击Edit -> Preferences -> Advanced -> General,点击页面上的config Editor

然后,搜索extensions.zotero.findPDFs.resolvers

双击extensions.zotero.findPDFs.resolvers,将默认情况下是只有一对[] 替换为如下内容,并点击OK

{
    "name":"Sci-Hub",
    "method":"GET",
    "url":"https://sci-hub.ren/{doi}",
    "mode":"html",
    "selector":"#pdf",
    "attribute":"src",
    "automatic":true
}

经过上述设置,在添加文献条目,或者对某已存在的文献条目点击Find Available PDF时,则自动通过网址 https://sci-hub.ren 进行搜索和下载。

注意,sci-hub的网址总是变动的,并且不同地区的不同网址的下载速度不同,请根据自身情况,自行变更此网址。

学习Zotero过程中阅读资料

技术笔记 - 阳志平的网志

愚木子| Zotero: 文献管理工具教程与实用插件汇总

青柠学术 | Zotero | 打造最佳文献生态(合集)

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