准备工作: 下载bismark及其依赖包perl、bowtie2或者histat2、samtools 下载参考基因...
Running bismark之后 用samtools view -h filename查看目录下的bam文件 其...
背景: RRBS数据bismark比对。 首先是从一篇简书上链接到这个参考基因组的链接,https://suppo...
0.质控 1.建立亚硫酸盐基因组index 2. 比对 输出结果有两个重要文件,一个bismark_bt2_PE_...
在《WGBS 全基因组甲基化测序》)讲解了 WGBS 测序原理,简而言之是 BS 处理将未甲基化 C 转化为 U(...
bismark 软件根据序列的比对情况就可以识别甲基化位点,首先需要对基因组建立索引,建好索引之后,就可以开始比对...
在上次的文章中简单的介绍了bismark的基本知识DNA甲基化分析----------甲基化比对软件专题(Bi...
1、RRBS简介 RRBS即reduced representation bisulfite sequencing...
Bismark是进行甲基化分析过程中常用到的软件,可以将bisulfite处理后的测序reads比对到参考基因组上...
本文标题:用bismark比对RRBS(三)原理
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/lezvbktx.html
网友评论