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「Debug R」一个Seurat导致的Rstudio网页版经常

「Debug R」一个Seurat导致的Rstudio网页版经常

作者: xuzhougeng | 来源:发表于2020-05-02 18:32 被阅读0次

    在网页版的Rstuio加载Seurat时,等待了很久都没有成功,刷新网页后就出现了如下的提示

    报错信息

    测试了其他包,例如ggplot2,都没有任何问题,唯独是Seurat出现了问题,因此我用关键词"seurat cause rsession terminated" 进行搜索,发现有人在Rstudio的社区上提出了这个问题,看来我并不是一个人遇到这个问题。

    我尝试里帖子https://community.rstudio.com/t/r-studio-crashes-when-loading-seurat-package/57931的解决方法,也就是卸载reticulate, 卸载Seurat,然后重装Seurat,但是对我而言没有什么效果。

    remove.packages('reticulate')
    remove.packages('Seurat')
    install.packages('Seurat')
    library(Seurat)
    

    我测试了重启Rstudio服务器,发现这也没有什么效果。甚至将我的Rstudio-server升级到最新版本,也没有解决这个问题。

    令人吃惊的是,这个问题只在我的用户中存在,其他用户并没有这个报错。

    因此,目前我想到了下面几种解决方法:

    1. 使用jupyter notebook
    2. 新建一个用户
    3. 等待Rstudio-serve更新的版本解决这个问题

    难受。。。

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