2021-06-21 转录因子数据库

        转录因子（transcription factors，TFs）作为调控细胞中最重要一类蛋白质，对于维持细胞生命活动和细胞时空特异性基因表达起到至关重要的调控作用。一般将转录因子分为两类：普通转录因子，例如TFⅡA，TFⅡB等直接与RNA聚合酶形成转录复合体参与基因转录；另一类为特异性转录因子，它负责调控基因的时空特异性表达，是细胞种类与功能多样性的重要原因。转录因子一般具有DNA结合功能域和/或转录调控功能域。目前在人类中鉴定的转录因子超过2000种，结合染色质免疫共沉淀（ChIP）和Cut-tag等技术，已经解析了部分转录因子在染色质上的结合区与结合基序，这对于深入了解转录因子的特性，转录过程的机制以及基因的时空表达特性具有重要作用。而今天要介绍的是一个转录因子数据库AnimalTFDB，它收集整理了包括人在内的97中动物的转录因子及转录辅助因子。

AnimalTFDB

三言两语

1. 汇总97中动物的TF，并进行分类整理。

2.提供针对转录因子的GO/KEGG/PPI等注释信息与RNA和蛋白表达信息。

3.提供在线判断蛋白是否为TF的工具。

4.提供预测给定DNA序列的TF结合位点的在线工具。

Reference

1. http://bioinfo.life.hust.edu.cn/AnimalTFDB/#!/