最近需要可视化不同亚型，不同分期癌症中X分子的高表达与低表达与患者预后的关系。下面主要是两种方法。
如果分析的数据来源于GEO，有一个很好用的在线网页（KMplotter，http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background）可以进行乳腺癌，肺癌，卵巢癌， 胃癌，肝癌等癌种中基因与预后关系的结果分析。如下图所示：
1. 选择需要的癌种（以乳腺癌为例）
选择乳腺癌
2.进行分子的输入以及参数的设置，
图1 1，进行目标分子的输入，有些分子可能对应多个探针，可以根据需要多测试几个。2，患者分组设置，median表示根据表达从中间分。3，选择需要分析的预后类型（OS,DMFS,RFS,PPS）。4，选择随访时间，可根据需要选择也可以不选择，默认所有。5，选择探针的类型，可以根据推荐选择最佳也可以用自己选择的，圆圈里显示选择条件下的患者人数。
图1 设置第一部分
图2 此处可以进行生成图片形式的设置，export plot data as text可以进行数据的下载。
图2 设置第二部分
图3 此处进行亚型、分期、分级，放化疗的相关设置。
图3 设置第三部分
图4 分析结果图，P值为显著性.HR为风险值，HR>1,bad prognostic factor,HR<1,good prognostic factor.
图4 结果图
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