Autodock分子对接完后会生成一个dlg格式的文件

1.查看对接结果

1.1 打开dlg文件

Analyze->Docking->Open->选择.dlg文件->确定

1.2 加上受体大分子

Analyze->Macromolecule->Open

1.3 查看对接能量的合理性

Analyze-clusterings -show
横坐标为Binding energy(结合能)，纵坐标为conformations(构象)

Fig1.PNG

点击可以查看对接的结果。

1.4 查看对接结果详细信息

Analyze->Conformations->Play，ranked by energy
在弹出来的选项框中，选择opens panel to change play options，在show info打勾✔
出现 Conformation x Info

binding energy range in this cluster of x 结合能排序
binding_erergy结合能
ligand_effciency配体效率
inhib_constant抑制常数
inhib_constant_units抑制常数单位
intermal_energy内能
vdw_hb_desolv_energy
electrostatic_energy 静电能
total_intermal
torsional_energy扭转能量
unbound_energy释放的能量
hydrogen bonds forme形成的d氢键

2. 保存

选择某一构想，点击Write Complex