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pyradiomics报错“Image/Mask geometr

pyradiomics报错“Image/Mask geometr

作者: CrimsonUMO | 来源:发表于2022-11-21 23:44 被阅读0次

在pyradiomics提取特征的过程中弹出报错:

ValueError: Image/Mask geometry mismatch. Potential fix: increase tolerance using geometryTolerance, see Documentation:Usage:Customizing the Extraction:Settings:geometryTolerance for more information

具体原因是什么我没细琢磨,但是根据报错提示的解决办法是可以搞定的。根据报错提示,应该是要修改geometryTolerance这个参数的值。

pyradiomics的官方文档是这么说的:

  • geometryTolerance [None]: Float, determines the tolarance used by SimpleITK to compare origin, direction and spacing between image and mask. Affects the fist step in checkMask(). If set to None, PyRadiomics will use SimpleITK default (1e-16).

解决办法是在初始化特征提取器的时候,在括号内添加geometryTolerance参数。这个值应该是个浮点值。如:

extractor = featureextractor.RadiomicsFeatureExtractor(geometryTolerance = 1e-5)

然后正常运行就好了

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