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用multiqc工具整合多个fastqc的结果

用multiqc工具整合多个fastqc的结果

作者: 小明的数据分析笔记本 | 来源:发表于2022-02-01 07:26 被阅读0次

    我的fastqc结果输出

    image.png

    查找当前目录下所有的.zip结尾的文件,将结果输出到一个文件里

    find ./ -name "*.zip" > file.list
    

    新建一个文件夹保存multiqc的输出结果

    mkdir multiqc.output
    

    运行multiqc

    multiqc --file-list file.list -o multiqc.output
    
    image.png

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