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awk小技巧

awk小技巧

作者: sober01 | 来源:发表于2017-10-26 17:48 被阅读21次
    1. 按列拆分
    awk '{print > $3}' all.gff3
    
    gff3文件 将gff3按第三列拆分
    1. 行-列转化
      需要将如下格式转换成“一个基因号对应一个 GO 号”

    转化命令:awk '{gsub(/,/, "\n"$1"\t");print}' pta_go.txt > pta_go.annot

    参考:http://mp.weixin.qq.com/s/JuuQ3wFJq72A36t5-arHIg

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