三十六策 第 2 策 化型为模

三十六策 第 2 策 化型为模

化型为模

化型为模，型还是表型的概念，模是模型。化...为...的句式，这是一个等同于的意思——明确了表型，模型属于一种关联性的常识。

疾病+表型→模型的选择 疾病→模型的种类 表型→模型的特征 把模型理解为表型标签的注释。（原本比较抽象的表型具体化，变成细胞、动物模型和组织标本选择的问题）

做基础科研，一旦疾、型参数确定，第一环节应该是解决接下来用什么细胞模型开展实验。从经济效率角度，也应该是 先大范围的开展细胞研究，等到某些结果比较确定了，再进行动物水平的验证。

细胞+动物还两个非常专业的术语:in vitro and in vivo，就是体外和体内的概念。ex vivo 是有定义的，特指直接活体取材，还有体外培养细胞体内回输的实验。

细胞模型其实可分为两大类：

• 一类是商业化的细胞株，买来直接用，也可以传代扩增;

• 另一类是基于人体或者动物模型分离的原代细胞。能用细胞系的千万别碰原代细胞!

大多数文章，在编排 Figures 的时候， 都是按照细胞一块（ in vitro），动物一块（in vivo ），组织标本检测一块（ex vivo）（组织直接检测就是 in situ， 分离出来原代细胞再研究归为 ex vivo），这样排布。

生物信息学分析in silico

五个维度的数据：细胞功能数据，动物实验数据，组织标本数据，分子机制数据，生信分析数据。

关于模型什么是大问题呢?

根据其制作的原理，主要归为自发和诱发两种类型

• 自发模型：模型本身就代表疾病状态，有典型的疾病表型，

• 诱发模型：就是需要加药或者缺氧、高糖等外界条件干预下 造成疾病的表现。

• 转基因动物模型：来自于转基因动物的数据比诱导建模的动物模型证据等级高。

选几篇权威期刊报道的论著， 对文章中采用的表型评价标准，包括什么模型，什么诱导条件，检测什么指标，用到哪些实 验方法研究的细致一点，就能基本掌握其中套路常识。

Tip：在电脑里新建一个文件夹，把看到的常规的实验方法的描述统统摘录下来，按照实验名称把文件放在那里。