GSEA（一|原理）

#######个人理解

没有人为设定cut off值，而是首先进行差异分析，将所有基因Fold Change的log值进行从正到负排序，建立一个gene list（假设有10000个基因）。

选择要研究的基因（eg:FBXO7），假设与FBXO7相关的基因有50个（基因F），将上述gene list中的基因一个个拿过来比对，如果list中的这个基因L在基因F1家族之中，那就给这个基因F1加分，如果不是，就减分。

因为list中的基因已经排好序了，处于同一家族的基因位置靠近，当这一段list在基因F1的家族中时，基因F1的打分会不断增加，直至处于峰值（>0），这段list gene比对完之后，由于之后的list中gene在基因F家族中的不断减少，F的打分也会不断降低。

这样就可以分析基因F1正向富集在gene list的哪一段，同理也可知道F1负向富集（抑制）的情况。

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