基因的FPKM等于各转录本FPKM之和

作者: F_U_N | 来源:发表于2019-08-09 21:28 被阅读0次

基因和转录本定量hppRNA STAR-RSEM-Ebseq 流程的四个样本

gene_id	KO1	KO2	Con1	Con2
DAG1	139.31	112.86	102.46	120.14

transcript_id	gene_id	KO1	KO2	Con1	Con2
NM_001177642	DAG1	2.37	2.1	0.95	0.88
NM_001177640	DAG1	1.51	1.62	1.09	0
NM_001177639	DAG1	79.93	70.07	67.33	99.38
NM_001177644	DAG1	0.51	0.21	0.82	0
NM_001177643	DAG1	17.18	13.62	12.34	8.26
NM_001177641	DAG1	0	0	0.13	0.53
NM_001177635	DAG1	2.71	0.22	2.26	0.49
NM_004393	DAG1	32.77	23.12	16.73	10.22
NM_001177634	DAG1	0.62	0.07	0	0.09
NM_001177638	DAG1	0.39	0.19	0	0
NM_001165928	DAG1	0	0.24	0	0
NM_001177637	DAG1	0	1.09	0	0.03
NM_001177636	DAG1	1.32	0.32	0.81	0.26
	SUM	139.31	112.87	102.46	120.14

FPKM(gene） = FPKM（transcript 1） + FPKM（transcript 2） + FPKM（transcript 3） + FPKM（transcript n）

本文标题：基因的FPKM等于各转录本FPKM之和

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