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如何利用系统缓存优化程序的运行效率?

如何利用系统缓存优化程序的运行效率?

作者: tracy_668 | 来源:发表于2021-01-16 19:35 被阅读0次

    上一节,我们学习了内存性能中 Buffer 和 Cache 的概念。简单复习一下,Buffer 和 Cache 的设计目的,是为了提升系统的 I/O 性能。它们利用内存,充当起慢速磁盘与快速 CPU 之间的桥梁,可以加速 I/O 的访问速度。

    Buffer 和 Cache 分别缓存的是对磁盘和文件系统的读写数据。

    • 从写的角度来说,不仅可以优化磁盘和文件的写入,对应用程序也有好处,应用程序可以在数据真正落盘前,就返回去做其他工作。
    • 从读的角度来说,不仅可以提高那些频繁访问数据的读取速度,也降低了频繁 I/O 对磁盘的压力。

    既然 Buffer 和 Cache 对系统性能有很大影响,那我们在软件开发的过程中,能不能利用这一点,来优化 I/O 性能,提升应用程序的运行效率呢?

    答案自然是肯定的。今天,我就用几个案例帮助你更好地理解缓存的作用,并学习如何充分利用这些缓存来提高程序效率。

    为了方便你理解,Buffer 和 Cache 我仍然用英文表示,避免跟“缓存”一词混淆。而文中的“缓存”,通指数据在内存中的临时存储。

    缓存命中率

    在案例开始前,你应该习惯性地先问自己一个问题,你想要做成某件事情,结果应该怎么评估?比如说,我们想利用缓存来提升程序的运行效率,应该怎么评估这个效果呢?换句话说,有没有哪个指标可以衡量缓存使用的好坏呢?

    我估计你已经想到了,缓存的命中率。所谓缓存命中率,是指直接通过缓存获取数据的请求次数,占所有数据请求次数的百分比。

    命中率越高,表示使用缓存带来的收益越高,应用程序的性能也就越好。

    实际上,缓存是现在所有高并发系统必需的核心模块,主要作用就是把经常访问的数据(也就是热点数据),提前读入到内存中。这样,下次访问时就可以直接从内存读取数据,而不需要经过硬盘,从而加快应用程序的响应速度。

    这些独立的缓存模块通常会提供查询接口,方便我们随时查看缓存的命中情况。不过 Linux 系统中并没有直接提供这些接口,所以这里我要介绍一下,cachestat 和 cachetop ,它们正是查看系统缓存命中情况的工具。

    • cachestat 提供了整个操作系统缓存的读写命中情况。
    • cachetop 提供了每个进程的缓存命中情况。

    这两个工具都是 bcc 软件包的一部分,它们基于 Linux 内核的 eBPF(extended Berkeley Packet Filters)机制,来跟踪内核中管理的缓存,并输出缓存的使用和命中情况。

    这里注意,eBPF 的工作原理不是我们今天的重点,记住这个名字即可,后面文章中我们会详细学习。今天要掌握的重点,是这两个工具的使用方法。

    使用 cachestat 和 cachetop 前,我们首先要安装 bcc 软件包。比如,在 Ubuntu 系统中,你可以运行下面的命令来安装:

    sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys 4052245BD4284CDD
    echo "deb https://repo.iovisor.org/apt/xenial xenial main" | sudo tee /etc/apt/sources.list.d/iovisor.list
    sudo apt-get update
    sudo apt-get install -y bcc-tools libbcc-examples linux-headers-$(uname -r)
    

    操作完这些步骤,bcc 提供的所有工具就都安装到 /usr/share/bcc/tools 这个目录中了。不过这里提醒你,bcc 软件包默认不会把这些工具配置到系统的 PATH 路径中,所以你得自己手动配置:

    $ export PATH=$PATH:/usr/share/bcc/tools
    

    配置完,你就可以运行 cachestat 和 cachetop 命令了。比如,下面就是一个 cachestat 的运行界面,它以 1 秒的时间间隔,输出了 3 组缓存统计数据:

    
    $ cachestat 1 3
       TOTAL   MISSES     HITS  DIRTIES   BUFFERS_MB  CACHED_MB
           2        0        2        1           17        279
           2        0        2        1           17        279
           2        0        2        1           17        279 
    

    你可以看到,cachestat 的输出其实是一个表格。每行代表一组数据,而每一列代表不同的缓存统计指标。这些指标从左到右依次表示:

    TOTAL ,表示总的 I/O 次数;
    MISSES ,表示缓存未命中的次数;HITS ,表示缓存命中的次数;
    DIRTIES, 表示新增到缓存中的脏页数;
    BUFFERS_MB 表示 Buffers 的大小,以 MB 为单位;CACHED_MB 表示 Cache 的大小,以 MB 为单位。

    接下来我们再来看一个 cachetop 的运行界面:

    
    $ cachetop
    11:58:50 Buffers MB: 258 / Cached MB: 347 / Sort: HITS / Order: ascending
    PID      UID      CMD              HITS     MISSES   DIRTIES  READ_HIT%  WRITE_HIT%
       13029 root     python                  1        0        0     100.0%       0.0%
    

    它的输出跟 top 类似,默认按照缓存的命中次数(HITS)排序,展示了每个进程的缓存命中情况。具体到每一个指标,这里的 HITS、MISSES 和 DIRTIES ,跟 cachestat 里的含义一样,分别代表间隔时间内的缓存命中次数、未命中次数以及新增到缓存中的脏页数。

    而 READ_HIT 和 WRITE_HIT ,分别表示读和写的缓存命中率。

    指定文件的缓存大小

    除了缓存的命中率外,还有一个指标你可能也会很感兴趣,那就是指定文件在内存中的缓存大小。你可以使用 pcstat 这个工具,来查看文件在内存中的缓存大小以及缓存比例。

    pcstat 是一个基于 Go 语言开发的工具,所以安装它之前,你首先应该安装 Go 语言,你可以点击这里下载安装。

    安装完 Go 语言,再运行下面的命令安装 pcstat:

    
    $ export GOPATH=~/go
    $ export PATH=~/go/bin:$PATH
    $ go get golang.org/x/sys/unix
    $ go get github.com/tobert/pcstat/pcstat
    

    全部安装完成后,你就可以运行 pcstat 来查看文件的缓存情况了。比如,下面就是一个 pcstat 运行的示例,它展示了 /bin/ls 这个文件的缓存情况:

    
    $ pcstat /bin/ls
    +---------+----------------+------------+-----------+---------+
    | Name    | Size (bytes)   | Pages      | Cached    | Percent |
    |---------+----------------+------------+-----------+---------|
    | /bin/ls | 133792         | 33         | 0         | 000.000 |
    +---------+----------------+------------+-----------+---------+
    

    这个输出中,Cached 就是 /bin/ls 在缓存中的大小,而 Percent 则是缓存的百分比。你看到它们都是 0,这说明 /bin/ls 并不在缓存中。

    接着,如果你执行一下 ls 命令,再运行相同的命令来查看的话,就会发现 /bin/ls 都在缓存中了:

    
    $ ls
    $ pcstat /bin/ls
    +---------+----------------+------------+-----------+---------+
    | Name    | Size (bytes)   | Pages      | Cached    | Percent |
    |---------+----------------+------------+-----------+---------|
    | /bin/ls | 133792         | 33         | 33        | 100.000 |
    +---------+----------------+------------+-----------+---------+
    

    知道了缓存相应的指标和查看系统缓存的方法后,接下来,我们就进入今天的正式案例。

    跟前面的案例一样,今天的案例也是基于 Ubuntu 18.04,当然同样适用于其他的 Linux 系统。机器配置:2 CPU,8GB 内存。预先按照上面的步骤安装 bcc 和 pcstat 软件包,并把这些工具的安装路径添加到到 PATH 环境变量中。预先安装 Docker 软件包,比如 apt-get install docker.io

    案例一

    第一个案例,我们先来看一下上一节提到的 dd 命令。

    dd 作为一个磁盘和文件的拷贝工具,经常被拿来测试磁盘或者文件系统的读写性能。不过,既然缓存会影响到性能,如果用 dd 对同一个文件进行多次读取测试,测试的结果会怎么样呢?

    我们来动手试试。首先,打开两个终端,连接到 Ubuntu 机器上,确保 bcc 已经安装配置成功。

    然后,使用 dd 命令生成一个临时文件,用于后面的文件读取测试:

    
    # 生成一个512MB的临时文件
    $ dd if=/dev/sda1 of=file bs=1M count=512
    # 清理缓存
    $ echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches
    

    继续在第一个终端,运行 pcstat 命令,确认刚刚生成的文件不在缓存中。如果一切正常,你会看到 Cached 和 Percent 都是 0:

    
    $ pcstat file
    +-------+----------------+------------+-----------+---------+
    | Name  | Size (bytes)   | Pages      | Cached    | Percent |
    |-------+----------------+------------+-----------+---------|
    | file  | 536870912      | 131072     | 0         | 000.000 |
    +-------+----------------+------------+-----------+---------+
    

    还是在第一个终端中,现在运行 cachetop 命令:

    
    # 每隔5秒刷新一次数据
    $ cachetop 5
    

    这次是第二个终端,运行 dd 命令测试文件的读取速度:

    
    $ dd if=file of=/dev/null bs=1M
    512+0 records in
    512+0 records out
    536870912 bytes (537 MB, 512 MiB) copied, 16.0509 s, 33.4 MB/s
    

    从 dd 的结果可以看出,这个文件的读性能是 33.4 MB/s。由于在 dd 命令运行前我们已经清理了缓存,所以 dd 命令读取数据时,肯定要通过文件系统从磁盘中读取。

    不过,这是不是意味着, dd 所有的读请求都能直接发送到磁盘呢?

    我们再回到第一个终端, 查看 cachetop 界面的缓存命中情况:

    
    PID      UID      CMD              HITS     MISSES   DIRTIES  READ_HIT%  WRITE_HIT%
    \.\.\.
        3264 root     dd                  37077    37330        0      49.8%      50.2%
    

    从 cachetop 的结果可以发现,并不是所有的读都落到了磁盘上,事实上读请求的缓存命中率只有 50% 。

    接下来,我们继续尝试相同的测试命令。先切换到第二个终端,再次执行刚才的 dd 命令:

    
    $ dd if=file of=/dev/null bs=1M
    512+0 records in
    512+0 records out
    536870912 bytes (537 MB, 512 MiB) copied, 0.118415 s, 4.5 GB/s
    

    看到这次的结果,有没有点小惊讶?磁盘的读性能居然变成了 4.5 GB/s,比第一次的结果明显高了太多。为什么这次的结果这么好呢?

    不妨再回到第一个终端,看看 cachetop 的情况:

    
    10:45:22 Buffers MB: 4 / Cached MB: 719 / Sort: HITS / Order: ascending
    PID      UID      CMD              HITS     MISSES   DIRTIES  READ_HIT%  WRITE_HIT%
    \.\.\.
       32642 root     dd                 131637        0        0     100.0%       0.0%
    

    显然,cachetop 也有了不小的变化。你可以发现,这次的读的缓存命中率是 100.0%,也就是说这次的 dd 命令全部命中了缓存,所以才会看到那么高的性能。

    然后,回到第二个终端,再次执行 pcstat 查看文件 file 的缓存情况:

    
    $ pcstat file
    +-------+----------------+------------+-----------+---------+
    | Name  | Size (bytes)   | Pages      | Cached    | Percent |
    |-------+----------------+------------+-----------+---------|
    | file  | 536870912      | 131072     | 131072    | 100.000 |
    +-------+----------------+------------+-----------+---------+
    

    这两次结果说明,系统缓存对第二次 dd 操作有明显的加速效果,可以大大提高文件读取的性能。

    但同时也要注意,如果我们把 dd 当成测试文件系统性能的工具,由于缓存的存在,就会导致测试结果严重失真。案例二

    案列2

    接下来,我们再来看一个文件读写的案例。这个案例类似于前面学过的不可中断状态进程的例子。它的基本功能比较简单,也就是每秒从磁盘分区 /dev/sda1 中读取 32MB 的数据,并打印出读取数据花费的时间。

    为了方便你运行案例,我把它打包成了一个 Docker 镜像。 跟前面案例类似,我提供了下面两个选项,你可以根据系统配置,自行调整磁盘分区的路径以及 I/O 的大小。

    -d 选项,设置要读取的磁盘或分区路径,默认是查找前缀为 /dev/sd 或者 /dev/xvd 的磁盘。

    -s 选项,设置每次读取的数据量大小,单位为字节,默认为 33554432(也就是 32MB)。

    这个案例同样需要你开启两个终端。分别 SSH 登录到机器上后,先在第一个终端中运行 cachetop 命令:

    
    # 每隔5秒刷新一次数据
    $ cachetop 5 
    

    接着,再到第二个终端,执行下面的命令运行案例:

    
    $ docker run --privileged --name=app -itd feisky/app:io-direct
    

    案例运行后,我们还需要运行下面这个命令,来确认案例已经正常启动。如果一切正常,你应该可以看到类似下面的输出:

    
    $ docker logs app
    Reading data from disk /dev/sdb1 with buffer size 33554432
    Time used: 0.929935 s to read 33554432 bytes
    Time used: 0.949625 s to read 33554432 bytes
    

    从这里你可以看到,每读取 32 MB 的数据,就需要花 0.9 秒。这个时间合理吗?我想你第一反应就是,太慢了吧。那这是不是没用系统缓存导致的呢?

    我们再来检查一下。回到第一个终端,先看看 cachetop 的输出,在这里,我们找到案例进程 app 的缓存使用情况:

    
    16:39:18 Buffers MB: 73 / Cached MB: 281 / Sort: HITS / Order: ascending
    PID      UID      CMD              HITS     MISSES   DIRTIES  READ_HIT%  WRITE_HIT%
       21881 root     app                  1024        0        0     100.0%       0.0% 
    

    这个输出似乎有点意思了。1024 次缓存全部命中,读的命中率是 100%,看起来全部的读请求都经过了系统缓存。但是问题又来了,如果真的都是缓存 I/O,读取速度不应该这么慢。

    不过,话说回来,我们似乎忽略了另一个重要因素,每秒实际读取的数据大小。HITS 代表缓存的命中次数,那么每次命中能读取多少数据呢?自然是一页。

    前面讲过,内存以页为单位进行管理,而每个页的大小是 4KB。所以,在 5 秒的时间间隔里,命中的缓存为 1024*4K/1024 = 4MB,再除以 5 秒,可以得到每秒读的缓存是 0.8MB,显然跟案例应用的 32 MB/s 相差太多。

    至于为什么只能看到 0.8 MB 的 HITS,我们后面再解释,这里你先知道怎么根据结果来分析就可以了。

    这也进一步验证了我们的猜想,这个案例估计没有充分利用系统缓存。其实前面我们遇到过类似的问题,如果为系统调用设置直接 I/O 的标志,就可以绕过系统缓存。

    那么,要判断应用程序是否用了直接 I/O,最简单的方法当然是观察它的系统调用,查找应用程序在调用它们时的选项。使用什么工具来观察系统调用呢?自然还是 strace。

    继续在终端二中运行下面的 strace 命令,观察案例应用的系统调用情况。注意,这里使用了 pgrep 命令来查找案例进程的 PID 号:

    
    # strace -p $(pgrep app)
    strace: Process 4988 attached
    restart_syscall(<\.\.\. resuming interrupted nanosleep \.\.\.>) = 0
    openat(AT_FDCWD, "/dev/sdb1", O_RDONLY|O_DIRECT) = 4
    mmap(NULL, 33558528, PROT_READ|PROT_WRITE, MAP_PRIVATE|MAP_ANONYMOUS, -1, 0) = 0x7f448d240000
    read(4, "8vq\213\314\264u\373\4\336K\224\25@\371\1\252\2\262\252q\221\n0\30\225bD\252\266@J"\.\.\., 33554432) = 33554432
    write(1, "Time used: 0.948897 s to read 33"\.\.\., 45) = 45
    close(4)                                = 0
    

    从 strace 的结果可以看到,案例应用调用了 openat 来打开磁盘分区 /dev/sdb1,并且传入的参数为 O_RDONLY|O_DIRECT(中间的竖线表示或)。

    O_RDONLY 表示以只读方式打开,而 O_DIRECT 则表示以直接读取的方式打开,这会绕过系统的缓存。

    验证了这一点,就很容易理解为什么读 32 MB 的数据就都要那么久了。直接从磁盘读写的速度,自然远慢于对缓存的读写。这也是缓存存在的最大意义了。

    找出问题后,我们还可以在再看看案例应用的源代码,再次验证一下:

    
    int flags = O_RDONLY | O_LARGEFILE | O_DIRECT; 
    int fd = open(disk, flags, 0755);
    

    上面的代码,很清楚地告诉我们:它果然用了直接 I/O。

    找出了磁盘读取缓慢的原因,优化磁盘读的性能自然不在话下。修改源代码,删除 O_DIRECT 选项,让应用程序使用缓存 I/O ,而不是直接 I/O,就可以加速磁盘读取速度。

    app-cached.c 就是修复后的源码,我也把它打包成了一个容器镜像。在第二个终端中,按 Ctrl+C 停止刚才的 strace 命令,运行下面的命令,你就可以启动它:

    
    # 删除上述案例应用
    $ docker rm -f app
    
    # 运行修复后的应用
    $ docker run --privileged --name=app -itd feisky/app:io-cached
    

    还是第二个终端,再来运行下面的命令查看新应用的日志,你应该能看到下面这个输出:

    
    $ docker logs app
    Reading data from disk /dev/sdb1 with buffer size 33554432
    Time used: 0.037342 s s to read 33554432 bytes
    Time used: 0.029676 s to read 33554432 bytes
    

    现在,每次只需要 0.03 秒,就可以读取 32MB 数据,明显比之前的 0.9 秒快多了。所以,这次应该用了系统缓存。

    我们再回到第一个终端,查看 cachetop 的输出来确认一下:

    
    16:40:08 Buffers MB: 73 / Cached MB: 281 / Sort: HITS / Order: ascending
    PID      UID      CMD              HITS     MISSES   DIRTIES  READ_HIT%  WRITE_HIT%
       22106 root     app                 40960        0        0     100.0%       0.0%
    

    果然,读的命中率还是 100%,HITS (即命中数)却变成了 40960,同样的方法计算一下,换算成每秒字节数正好是 32 MB(即 40960*4k/5/1024=32M)。

    这个案例说明,在进行 I/O 操作时,充分利用系统缓存可以极大地提升性能。 但在观察缓存命中率时,还要注意结合应用程序实际的 I/O 大小,综合分析缓存的使用情况。

    案例的最后,再回到开始的问题,为什么优化前,通过 cachetop 只能看到很少一部分数据的全部命中,而没有观察到大量数据的未命中情况呢?这是因为,cachetop 工具并不把直接 I/O 算进来。这也又一次说明了,了解工具原理的重要。

    总结

    Buffers 和 Cache 可以极大提升系统的 I/O 性能。通常,我们用缓存命中率,来衡量缓存的使用效率。命中率越高,表示缓存被利用得越充分,应用程序的性能也就越好。

    你可以用 cachestat 和 cachetop 这两个工具,观察系统和进程的缓存命中情况。其中,

    1. cachestat 提供了整个系统缓存的读写命中情况。
    2. cachetop 提供了每个进程的缓存命中情况。

    不过要注意,Buffers 和 Cache 都是操作系统来管理的,应用程序并不能直接控制这些缓存的内容和生命周期。所以,在应用程序开发中,一般要用专门的缓存组件,来进一步提升性能。

    FAQ

    这里的direct i/o是不是上一节课里的直接操作磁盘的“裸i/o”呢?如果是的话是不是应该从buffer的角度分析实验二呢?

    不是的,直接IO是跳过Buffer,裸IO是跳过文件系统(还是有buffer的)

    请问第一次读50%的命中率如何解释呢?
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