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组装平台、工具比拼

组装平台、工具比拼

作者: 胡童远 | 来源:发表于2021-10-09 14:32 被阅读0次

标题:Comparison of De Novo Assembly Strategies for Bacterial Genomes
杂志:International Journal of Molecular Sciences
时间:2021
单位:四川农业大学

独立组装

A nanopore 独立组装
B pacbio独立组装
C illumina独立组装

混合组装

long-reads组装 + polishing

QUAST评估组装质量

BUSCO评估组装完整性

16S rDNA序列比对

转录本比对Assemblies

转录本比对CDS of assemblies

ONT的robustness

15个菌株组装结果汇总

不同测序平台比较

更多:
Int J Mol Sci(IF=5.9)|细菌基因组从头组装策略的比较

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