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绝大部分报错都应该是谷歌搜索解决

绝大部分报错都应该是谷歌搜索解决

作者: 因地制宜的生信达人 | 来源:发表于2018-12-26 00:49 被阅读68次

    绝大部分报错都应该是谷歌搜索解决

    最近在跟着jimmy大神的视频课程学习ChIP-seq数据,代码也是拷贝的大神的,如下:

    conda create -n chipseq python=2
     source activate chipseq
     conda install macs2s
    

    很简单就安装软件,而且很容易使用,如下:

    macs2 callpeak -c IgGold.bam -t RYBP.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n RYBP
    

    运行macs2的时候出现了报错,试了几种方法,把MACS单独安装在一个环境变量,升级下python3,结果都还是报错

    经过直接面对面jimmy大神的协助,安装了libgfortran==1,进行版本降级

    conda install libgfortran==1
    

    然后成功debug

    macs2 callpeak -c IgGold.bam -t ring1B.bam -q 0.05 -f BAM -g mm -n ring1B 2/ring1B.macs2.log
    

    其实大神就是根据报错信息谷歌了一下而已。

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