Hi-C 数据分析主要是来研究染色体的结构的，常见的三个空间单位有 Compartment, TAD, Loop 。
如上图所示，loop既为一个环状结构，环的入口处在空间上接近。不同与其他的随机接近，此处的接近频率是其他的多倍，所以会形成峰。基于这一点，就可以通过算法(HiCCUPS)将其与背景（随机连接）区分开，就是所谓的 call-peak。并且此处往往是CTCF 的作用位点，也是其他调控原件（增强子等）的作用位点。
Hi-C 数据分析主要是来研究染色体的结构的，常见的三个空间单位有 Compartment, TAD, Loop ...
欢迎关注”生信修炼手册”! 通过Hi-C数据可以分析TAD,chromatin loops等染色质空间结构的基本单...
文献：Topological Domains in Mammalian Genomes Identified by...
100 Days of Swift - 04 Day: loops, loops, and more loops ...
背景 经常在HiC文章中看到TAD边界强度变化图，大体上可以反映TAD之间隔绝情况,绝缘系数越低，TAD之间交互越...
ITEM 58: PREFER FOR-EACH LOOPS TO TRADITIONAL FOR LOOPS ...
一、 Hi-C Hi-C(High-through chromosome conformation capture...
Run Loops Run Loops描述（官方文档）Run Loops(运行循环)是与线程相关的基础架构的一部分...
loops and iteration py4E022-025 While while loops are cal...
What's Run Loops? Why Run Loops? 命令行式执行 Event驱动
本文标题：Hi-C: Compartment, TAD, Loops
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/npwzrctx.html
网友评论