美文网首页
数据库 | 地址收录

数据库 | 地址收录

作者: 胡童远 | 来源:发表于2021-04-28 10:30 被阅读0次

更新是一种习惯

NCBI
官网:ftp://ftp.ncbi.nih.gov/

# cog
https://ftp.ncbi.nih.gov/pub/COG/
# kog
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/pub/COG/KOG/
# go:官网:http://geneontology.org/
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/gene/DATA/gene2go.gz
# nt
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/db/nt.*.tar.gz
# nr
ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/db/nr.*.tar.gz
# tax
ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/taxdump.tar.gz
# vector
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/UniVec/

uniprot

# 官网:
https://www.uniprot.org/
# 数据
https://ftp.expasy.org/databases/uniprot/current_release/uniref/

kegg

# kofamscan
ftp://ftp.genome.jp/pub/db/kofam/ko_list.gz 
ftp://ftp.genome.jp/pub/db/kofam/profiles.tar.gz 
# pathway maps
https://www.genome.jp/kegg-bin/get_htext?br08901.keg

vfdb: 毒力因子

# 官网
http://www.mgc.ac.cn/VFs/download.htm
# 数据
http://www.mgc.ac.cn/VFs/Down/VFDB_setB_pro.fas.gz

phi: 病原体宿主互作

# 官网
http://www.phi-base.org/
# 数据
http://www.phi-base.org/downloadLink.htm

tcdb: 膜转运蛋白

# 官网
http://www.tcdb.org/
# 数据
http://www.tcdb.org/download.php

swiss prot: 注释蛋白

# 官网
https://www.ebi.ac.uk/uniprot/
# 数据
https://www.uniprot.org/downloads

pfam: 蛋白家族注释

# 官网
http://pfam.xfam.org/
# 数据
ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/Pfam/current_release/Pfam-A.full.gz

card:抗生素耐受基因

# 官网:
https://card.mcmaster.ca/
# 数据:
https://card.mcmaster.ca/download/0/broadstreet-v3.1.2.tar.bz2

NCBI virus

# 官网
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/viruses/
# 数据
https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/viral/

NCBI refseq: https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/refseq/release/

相关文章

网友评论

      本文标题:数据库 | 地址收录

      本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/nrtvrltx.html