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前向特征选择

前向特征选择

作者: 裁尘的人儿 | 来源:发表于2019-07-04 21:21 被阅读0次

    with open('30second_genes_list.txt', 'w') as f:

    #    declare the method

        selector = FwdSelect()

    #    fit the selector with the cell data

        selector.fit(df.values)

    #    rank the features

        idx = selector.ordered_features

    #    get top 20 features

        ls = [gene_list[e] for e in idx][:20]

    #    write down selected genes into a file

        f.write('\n'.join(ls))

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