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DNA甲基化标准品

DNA甲基化标准品

作者: HyCyte海星 | 来源:发表于2022-08-01 09:31 被阅读0次

    DNA甲基化水平和模式的改变是肿瘤发生的一个重要因素,这些变化包括CpG岛局部的高甲基化和基因组DNA低甲基化状态。由于CpG岛的局部高度甲基化要早于细胞恶性增生,故其甲基化的检测可用于肿瘤的预测,而全基因组水平的低水平甲基化状态,则随着肿瘤恶性程度的增加而进一步降低,使其可用于肿瘤的诊断以及分级。甲基化可作为肿瘤等早期诊断的生物标记物和预后评估指标,对肿瘤的筛查和风险评估、早期诊断、分期分型、预后判断及治疗检测都有重要意义。

    甲基化分析的方法主要有以下几种:甲基化敏感性限制性内切酶-PCR/Southern法(MSRE-PCR/Southern)、重亚硫酸盐测序法(Bisulfite Sequencing)、甲基化荧光PCR法(MethyLight)、甲基化特异性PCR(MS-PCR)、焦磷酸测序等。

    近几年, NMPA批准的甲基化检测试剂盒均为荧光PCR法,主要原因在于荧光PCR法操作简便,无需在PCR后电泳,且具有灵敏度高、特异性强、重复性好等特点。其主要原理如下:先用重亚硫酸盐处理待测DNA片段,设计一个能与待测位点区互补的探针,探针的5’端连接报告荧光,3’端连接淬灭荧光,随后一般采用MSP引物进行实时定量PCR。但该方法多为单重PCR检测,没有内参基因的扩增,不能确保模板DNA的硫化修饰质量。

    根据NMPA官网数据显示,目前甲基化检测种类涉及septin9、SHOX2、RASSF1A、RNF180、SDC2、MGMT、BMP3、NDRG4等基因;涉及的检测项目包括胃癌、结直肠癌、大肠癌、胶质瘤等癌种。海星生物基于肿瘤早筛热门靶点,设置了低甲基化水平的阴性对照品和高甲基化水平的阳性对照品,适用于BSP、MethyLight、MS-PCR、焦磷酸测序等多种平台的性能评估。样本来源于人类细胞系,最大程度接近患者样本,无伦理风险;质量高度稳定,均一性好,可持续提供,批次稳定,可溯源。海星生物所有Methylation标准品均经过BSP法QC验证,这种方法一度被认为是DNA甲基化分析的金标准,其过程如下:经过亚硫酸氢盐处理后,用PCR扩增目的片段,并对PCR产物进行测序,将序列与未经处理的序列进行比较,判断CpG位点是否发生甲基化。这种方法可靠,且精确度高,能明确目的片段中每一个CpG位点的甲基化状态。

    A基因低甲基化细胞株(2.1%, BSP验证):

    高甲基化细胞株(96.2%, BSP验证):

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