1.1 DSS的优势:可以处理没有重复的数据。它可以通过smoothing,将邻近的cpg位点作为假设的重复。
1.2 DSS找dmr的关键参数:
delta: 两组比较,显著差异区域的阈值。delta可以为0.1或者0.2, 可以计算出每个位点具有显著差异的概率值posterior probability (pp)。
p.threshold: 当1-pp < p.threshold时,可以定义该位点为显著差异位点。
1.1 DSS的优势:可以处理没有重复的数据。它可以通过smoothing,将邻近的cpg位点作为假设的重复。
1.2 DSS找dmr的关键参数:
delta: 两组比较,显著差异区域的阈值。delta可以为0.1或者0.2, 可以计算出每个位点具有显著差异的概率值posterior probability (pp)。
p.threshold: 当1-pp < p.threshold时,可以定义该位点为显著差异位点。
本文标题:DSS
本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/oakxjctx.html
网友评论