学习心得[引自生物星球]
- 检查软件
Linux输bzip2
- 安装bzip2
Linux输yum install -y bzip2
- 下载miniconda
miniconda官网,复制链接,下载
https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh - 复制
cd biosoft
进入biosoft,wget
复制,下载。 - 安装
用bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
- 激活
source ~/.bashrc
激活conda - 添加镜像
conda config --add channels r
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
使用conda
- 查看当前所有软件列表 conda list
- 搜索软件
conda search fastqc
【这里以数据质控软件fastqc为例】 - 安装软件
conda install fastqc -y
【加上-y是自动安装,你可以试试不加-y有什么区别】 - 卸载软件
conda remove fastqc -y
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