出发点
一直以来,别人找过来,说是要讨论生物信息、讨论高通量测序,很抱歉,我从一开始就会亮出底牌,我是做生物的,不是做生信的。
没错,我就是一个做生物的。既然是做生物的,我写了大多数东西的出发点就是,
我们做湿实验的也看得懂,能重复,可以出没有原则性错误的结果
既然如此,既然改变不了搞生信的一班子,无法让他们写windows下能运行的东西,那么我们只能让步,搞搞一些linux。想来想去,那就用最粗暴的方式,我们搞搞大家都能搞定的虚拟机 -- VirtualBox
目的
在windows下安装VirtualBox,
使用最友好最简单Linux运行班,Ubuntu
下载ubuntu系统安装文件
进入ubuntu官网,进入下载页面,点击Download
image跳转到新的页面,如果你愿意的话,那么可以捐助,一般直接点击“Not now...”,进入下载页面
image一般这种情况会弹出下载对话框,可以下载ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso
,如果没有,那么点击download now
。并等待下载完成
于是我们得到了ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso
这个文件,后面可以用于创建虚拟机。
下载与安装VirtualBox
进入VirtualBox官网,进入下载页面
点击Windows hosts,下载对应VirtualBox安装包
image下载结束之后,双击图标安装
image一直下一步即可安装完成,
安装过程可能会影响当前机器的网络,应是在进行网络桥接
打开后界面如下
image创建一个新的虚拟机,进入专家模式,调整对应的参数,我们至少要保留4G的内存,不然就很麻烦
image image点击创建,进入下一步,有必要的话,我们自定义一个虚拟机文件放置位置
image确定位置之后,我们给50Gb的硬盘空间,同时设置为固定大小,这样运行起来会很快,都要分析数据了,这点空间不算什么
image开始创建
image创建好了之后是这样的
image在VituralBox上安装Ubuntu系统
双击该虚拟机,会弹出选择启动盘
image随后选择之前下载的ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso
,并点击启动即可
注意
如果没有弹出这个选项,而是显示
image那么可能是因为之前取消过,那么就点击设备
,选择分配光驱
,点击选择虚拟盘
此时在弹出电话框中,选择之前下载的 ubuntu-16.04.4-desktop-amd64.iso
随后关闭关闭虚拟机,并双击重启即可进入Ubuntu安装界面
安装Ubuntu
image接下来的步骤,基本全部直接点击下一步即可
在时间区域,或许可以直接选择上海
image选择键盘
image设置一些有的没的信息
image然后就开始安装
image过程还是比较顺畅,没有发现什么问题
安装完成直接,会提示重启虚拟机的Ubuntu系统,进入之后可能看到提示,大概意思是,请移除系统安装介质的英文,那是因为刚才的光盘没有弹出,可能可以做以下操作
image随后重启虚拟机即可
imageOK,就这样,安装完成
一些可选设置(可选),可以提高运行性能
默认会开启的虚拟化参数
image启动3D加速,如此图形化界面不会卡顿
image重新开启Ubuntu,输入密码,进入Ubuntu
image点击安装增强功能
,
随后在Ubuntu里面会出现安装弹窗,选择Run
等待安装完毕即可
如果失败,如下
image那么这个时间就回车
尝试更新一下系统,是否能行
在桌面上,鼠标邮件,重新打开命令行,
image输入sudo apt-get update
,随后输入密码,回车
类似的,输入sudo apt-get upgrade
输入Y就可以了,等着升级完成
image如果直接重新点击安装增强功能,应该会失败
image那么可以弹出光盘尝试
image结果还是一样,考虑到提示,意思就是Until the system restart
,那么就重新关闭这个虚拟机,重启一次Ubuntu即可
同样,输入登录密码,进入系统,重新选择安装增强功能
image从上图的提示可以看到,我们已经成功了
设置共享文件夹
毕竟我们是在windows下面操作的比较多,如何将windows下的文件,直接在虚拟机的Linux下使用,这个应是会直接影响我们的工作,所以需要设置一下共享文件夹
如此,先在windows下,创建一个目录
image随后回到虚拟机的Ubuntu窗口,点击共享文件夹 (PS: 顺便共享剪切板,双向)
image设置好选项
image image随后在弹出的对话框中选择刚才我们创建的文件夹
image点击OK,确定添加,并点击OK,即可
随后在桌面,鼠标邮件,打开Terminal
依次输入以下命令
ls
cd Desktop
mkdir share
sudo mount -t vboxsf share share
分别是列出当前目录内容,进入Desktop这个文件夹,创建一个文件夹叫做share,挂载共享目录
image挂载完成,以后,凡是在share目录下的文件,无论是windows下,还是Linux下,都可以直接看到
image image似乎保存不了,于是我直接重新在linux下创建了一个new.txt
随后黏贴文本,保存,直接在windows下打开
没问题。
设置开机自动挂载
以上操作,虚拟机重启之后,就会消失,所以我们需要设置下虚拟机中Ubuntu的开机自动挂载共享目录
切换到root用户,并编辑类似windows开机启动项的文件 rc.local
sudo -s
nano /etc/rc.local
在exit 0
的上一行添加以下命令,即为共享目录挂载命令
sudo mount -t vboxsf share /home/tbtools/Desktop/share
ctrl+X,随后摁键盘Y,表示确认保存
推送结束
嗯....这只是一个铺垫,
虽然我们要尽可能避免使用linux,但是很多时候还是没有办法
网友评论